公开(公告)号：CN113764043B

公开(公告)日：2022-05-20

申请号：CN202111063261.4

申请日：2021-09-10

Applicant: 东北林业大学 ,  电子科技大学长三角研究院(衢州)

Inventor： 赵玉茗 ,  汪国华 ,  宫越 ,  邹权

IPC: G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G16B50/30 ,  G06K9/62

Abstract: 基于位置特异性得分矩阵的囊泡转运蛋白识别方法及识别设备，本发明涉及囊泡转运蛋白识别方法及识别设备。本发明的目的是为了解决现有囊泡转运蛋白的识别方法效率低、成本高的问题。过程为：S1、获取蛋白序列数据文件；S2、基于S1生成位置特异性得分矩阵，并采用AATP算法从位置特异性得分矩阵中提取特征向量；S3、使用不平衡处理算法得到处理后的特征向量；S4、采用MRMD算法得到特征向量集合；S5、采用XGBoost作为分类器，并进行超参数优化；S6、得到训练好的分类器模型；S7、将待测数据集输入训练好的分类器模型得到分类结果，完成对囊泡转运蛋白的识别。本发明用于蛋白识别领域。

公开(公告)号：CN113764043A

公开(公告)日：2021-12-07

申请号：CN202111063261.4

申请日：2021-09-10

Applicant: 东北林业大学 ,  电子科技大学长三角研究院(衢州)

Inventor： 汪国华 ,  宫越 ,  邹权

IPC: G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G16B50/30 ,  G06K9/62

Abstract: 基于位置特异性得分矩阵的囊泡转运蛋白识别方法及识别设备，本发明涉及囊泡转运蛋白识别方法及识别设备。本发明的目的是为了解决现有囊泡转运蛋白的识别方法效率低、成本高的问题。过程为：S1、获取蛋白序列数据文件；S2、基于S1生成位置特异性得分矩阵，并采用AATP算法从位置特异性得分矩阵中提取特征向量；S3、使用不平衡处理算法得到处理后的特征向量；S4、采用MRMD算法得到特征向量集合；S5、采用XGBoost作为分类器，并进行超参数优化；S6、得到训练好的分类器模型；S7、将待测数据集输入训练好的分类器模型得到分类结果，完成对囊泡转运蛋白的识别。本发明用于蛋白识别领域。