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公开(公告)号：CN116434842A
公开(公告)日：2023-07-14
申请号：CN202310414041.4
申请日：2023-04-18
Applicant: 上海市东方医院(同济大学附属东方医院)
Abstract: 本发明提供了一种生物样本信息的处理方法，包括以下步骤：获取待测生物样本及多个已知的参考生物样本的转录组信息；基于转录组信息，对待测生物样本及多个参考生物样本进行基于全基因的全局分析、基于差异基因的局部分析、基于基因差异表达分析的特征分析及非负最小二乘回归分析；以及根据全局分析结果、局部分析结果、特征分析结果及非负最小二乘回归分析结果，确定待测生物样本的总体特性。本发明基于高通量测序数据，研究和建立了一套可用于系统性评价细胞、组织等生物样本间相似性的方法，并基于该方法建立一种判断细胞谱系阶段、所处状态的研究策略，对特定细胞类型、亚群在不同谱系细胞中的具体定位提供参考价值。
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公开(公告)号：CN113106160A
公开(公告)日：2021-07-13
申请号：CN202110391145.9
申请日：2021-04-12
Applicant: 上海市东方医院(同济大学附属东方医院)
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/113
Abstract: 本发明提供了一种评估肝谱系细胞成熟度的标志物、双组学试剂盒及构建方法。本发明首次以新视角阐述了细胞发育中具有时序特征并且存在调控关系的microRNA集和基因集，建立了一种与调节肝细胞分化成熟相关的“转录因子‑microRNA‑靶基因”调控网络，并获得了肝谱系特异性的基因标签和microRNA标签，这些标签或它们的组合可作为肝谱系细胞潜在的新标志物。本发明也提供了肝谱系细胞的双组学试剂盒，为大规模扩增稳定的肝谱系细胞、监测肝谱系细胞的体外培养状态提供了新方案。
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公开(公告)号：CN116355836A
公开(公告)日：2023-06-30
申请号：CN202310369365.0
申请日：2023-04-07
Applicant: 上海市东方医院(同济大学附属东方医院)
IPC: C12N5/071
Abstract: 本发明提供了一种胆管树干细胞的扩增或传代体系及其应用。利用本发明的体系，不需要在胆管树干细胞内导入外源基因，常规培养即可实现细胞的扩增、扩增效率非常高，所获得的胆管树干细胞可传代。本发明可在保证细胞大量扩增的同时，维持组织干细胞的干性。
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公开(公告)号：CN113106160B
公开(公告)日：2022-11-01
申请号：CN202110391145.9
申请日：2021-04-12
Applicant: 上海市东方医院(同济大学附属东方医院)
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/113
Abstract: 本发明提供了一种评估肝谱系细胞成熟度的标志物、双组学试剂盒及构建方法。本发明首次以新视角阐述了细胞发育中具有时序特征并且存在调控关系的microRNA集和基因集，建立了一种与调节肝细胞分化成熟相关的“转录因子‑microRNA‑靶基因”调控网络，并获得了肝谱系特异性的基因标签和microRNA标签，这些标签或它们的组合可作为肝谱系细胞潜在的新标志物。本发明也提供了肝谱系细胞的双组学试剂盒，为大规模扩增稳定的肝谱系细胞、监测肝谱系细胞的体外培养状态提供了新方案。
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公开(公告)号：CN219328665U
公开(公告)日：2023-07-11
申请号：CN202320578601.5
申请日：2023-03-22
Applicant: 上海市东方医院(同济大学附属东方医院) , 上海赛傲生物技术有限公司
IPC: G01N1/36
Abstract: 本实用新型公开了一种薄膜组织的纵向固定包埋盒，包括：包埋模具、包埋盒底座；所述包埋模具与包埋盒底座相匹配，所述包埋模具上设置有用于装石蜡的凹槽；所述包埋盒底座上设置有包埋槽，所述包埋槽包括包埋槽底板和包埋槽侧壁，所述包埋槽底板和包埋槽侧壁连接，所述包埋槽底板包括栅格网部和螺旋状包埋部，所述螺旋状包埋部设置在包埋槽底板的中间位置，所述栅格网部与螺旋状包埋部连接，设置在螺旋状包埋部的四周。本实用新型提供的一种薄膜组织的纵向固定包埋盒，能使薄膜组织从包埋盒底座的螺旋状包埋部的空隙中立起来，这样不仅可以将单层膜纵向固定于石蜡中，而且面积扩大后能纵向切取更多的组织进行后续HE染色或者免疫组化等实验。
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