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公开(公告)号:CN116612817A
公开(公告)日:2023-08-18
申请号:CN202310581873.5
申请日:2023-05-22
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
IPC: G16B20/30 , G06N20/00 , G06N3/0895
Abstract: 本发明涉及一种对多样本混合的单细胞数据混样拆分的方法,属于单细胞分析技术领域。包括分别进行多样本混合的单细胞测序和各样本单独的批量线粒体测序;提取线粒体变异位点频率矩阵;筛选差异较大的高可变位点,对每个细胞与每个样本进行高可变位点频率的相关性系数计算,将每个单细胞中相关性系数值最大且大于0的对应样本作为该细胞的样本标签;通过半监督的机器学习模型,将单细胞线粒体变异位点频率矩阵中细胞间位点频率的相关性系数作为边,将每个单细胞作为点,从已知样本标签的点开始,将标签通过边向未知样本标签的点传播,直至达到模型停止条件,输出每个单细胞的预测标签。通过本发明获得的结果准确度高,计算效率高。