病原微生物诊断型基因芯片的快速检测方法

    公开(公告)号:CN1289691C

    公开(公告)日:2006-12-13

    申请号:CN03113853.5

    申请日:2003-03-04

    Abstract: 本发明公开了一种病原微生物诊断型基因芯片的快速检测方法,包括以下步骤:(1)玻片的准备;(2)探针准备:采用PCR扩增病原体全基因组的各个基因和特异性片段,探针长度从数百到数千碱基不等,浓度在0.25~0.5μg/μL;(3)芯片制备:采用基因芯片点样仪进行点样;(4)打印后处理;(5)样品的处理:在PCR扩增过程中,Cy5-dUTP进行掺入标记,在标记前或标记后引入限制性酶切,使获得片段长度在200~600bps之间;(6)杂交:2×杂交明冲液的配方为60%甲酰胺、12×SSC、0.24%SDS;(7)杂交后清洗;(8)扫描检测。本发明具有标记效率高、杂交检测结果稳定、杂交时间大大病短等优点,可将杂交时间从传统的16~20小时缩短到10分钟,尤其适用于临床感染性疾病的诊断。

    一种限制性荧光标记方法

    公开(公告)号:CN1473940A

    公开(公告)日:2004-02-11

    申请号:CN02134540.6

    申请日:2002-08-09

    Abstract: 本发明公开了一种限制性荧光标记方法,该方法依次包括以下步骤:(1)以限制性核酸内切酶消化由样品核酸提取纯化后反转录获得的cDNA或者以多对针对多种靶基因而设计的引物进行多重PCR扩增获得的扩增产物,产生许多大小较为一致的限制性基因片段;(2)设计接头,与上述限制性酶切片段连接;(3)根据上述限制性内切酶位点与接头序列设计PCR通用引物,并在上述引物的5′端标记上荧光分子;(4)以荧光标记的通用引物进行PCR扩增样品,该扩增样品经纯化后与DNA芯片杂交。本发明可显著增强杂交信号,并同时显著减少荧光物用量,大大提高芯片检测的灵敏度,尤其适合临床病原体基因的检测芯片。

    一种限制性荧光标记方法

    公开(公告)号:CN1329523C

    公开(公告)日:2007-08-01

    申请号:CN02134540.6

    申请日:2002-08-09

    Abstract: 本发明公开了一种限制性荧光标记方法,该方法依次包括以下步骤:(1)以限制性核酸内切酶消化由样品核酸提取纯化后反转录获得的cDNA或者以多对针对多种靶基因而设计的引物进行多重PCR扩增获得的扩增产物,产生许多大小较为一致的限制性基因片段;(2)设计接头,与上述限制性酶切片段连接;(3)根据上述限制性内切酶位点与接头序列设计PCR通用引物,并在上述引物的5′端标记上荧光分子;(4)以荧光标记的通用引物进行PCR扩增样品,该扩增样品经纯化后与DNA芯片杂交。本发明可显著增强杂交信号,并同时显著减少荧光物用量,大大提高芯片检测的灵敏度,尤其适合临床病原体基因的检测芯片。

    一种新型基因芯片表面的处理方法

    公开(公告)号:CN1584052A

    公开(公告)日:2005-02-23

    申请号:CN200410027316.6

    申请日:2004-05-26

    Abstract: 本发明公开了一种新型基因芯片表面的处理方法,该处理方法首先采用硅烷化试剂对玻片进行预处理;然后利用高分子聚合反应使丙烯酸和丙烯酰胺单体在玻片表面聚合,形成共价连接;在聚合反应发生的同时中引入活化分子,使其与聚合物中的酰胺基团发生化学反应,形成对氨基敏感的化学表面。用本发明方法处理的芯片表面具有稳定性好、固定效率高、操作流程简单、处理成本低的特点。

    一种通用引物联合标记法

    公开(公告)号:CN100359021C

    公开(公告)日:2008-01-02

    申请号:CN200510033396.0

    申请日:2005-03-07

    Abstract: 本发明公开了一种通用引物联合标记法,该方法设计了一种与病毒、细菌和人类基因同源性较低的通用引物U和随机通用引物UNN,通过优化的两轮扩增可以同时对各种微量的单链或双链DNA样品进行大量扩增标记并用于临床检测型芯片的杂交,从而能检测多种微量的临床样品。与常用的样品标记方法比较,本发明是一种高效、灵敏的荧光标记方法。

    一种消减杂交文库构建方法

    公开(公告)号:CN1231600C

    公开(公告)日:2005-12-14

    申请号:CN200310112066.1

    申请日:2003-11-07

    Abstract: 本发明公开了一种消减杂交文库构建方法,该方法包括以下步骤:(1)消减杂交装置的制备;(2)检测组和驱动组的酶切;(3)驱动组的固定;(4)检测组连接接头;(5)进行消减杂交;(6)消减产物的分组扩增;(7)消减杂交文库的构建。与传统的物理消减杂交方法相比,本发明具有以下优点:1)消减杂交装置成本低,制作简单;2)尼龙膜与核酸分子以共价键结合,结合牢固;3)在杂交过程中可控制杂交温度和时间;4)可根据需要控制杂交轮次;5)洗脱体积可按需要控制在数十微升,便于进一步的操作;6)试验操作简单,可重复性好;7)在消减杂交后进行PCR,避免了假阳性的出现;8)消减后进行分组PCR,可使低丰度的差异表达cDNA扩增。

    一种通用引物联合标记法

    公开(公告)号:CN1683563A

    公开(公告)日:2005-10-19

    申请号:CN200510033396.0

    申请日:2005-03-07

    Abstract: 本发明公开了一种通用引物联合标记法,该方法设计了一种与病毒、细菌和人类基因同源性较低的通用引物U和随机通用引物UNN,通过优化的两轮扩增可以同时对各种微量的单链或双链DNA样品进行大量扩增标记并用于临床检测型芯片的杂交,从而能检测多种微量的临床样品。与常用的样品标记方法比较,本发明是一种高效、灵敏的荧光标记方法。

    病原微生物诊断型基因芯片的快速检测方法

    公开(公告)号:CN1526829A

    公开(公告)日:2004-09-08

    申请号:CN03113853.5

    申请日:2003-03-04

    Abstract: 本发明公开了一种病原微生物诊断型基因芯片的快速检测方法,包括以下步骤:(1)玻片的准备;(2)探针准备:采用PCR扩增病原体全基因组的各个基因和特异性片段,探针长度从数百到数千碱基不等,浓度在0.25~0.5μg/μL;(3)芯片制备:采用基因芯片点样仪进行点样;(4)打印后处理;(5)样品的处理:在PCR扩增过程中,Cy5-dUTP进行掺入标记,在标记前或标记后引入限制性酶切,使获得片段长度在200~600bps之间;(6)杂交:2×杂交明冲液的配方为60%甲酰胺、12×SSC、0.24%SDS;(7)杂交后清洗;(8)扫描检测。本发明具有标记效率高、杂交检测结果稳定、杂交时间大大病短等优点,可将杂交时间从传统的16~20小时缩短到10分钟,尤其适用于临床感染性疾病的诊断。

    一种基因芯片表面的处理方法

    公开(公告)号:CN1271216C

    公开(公告)日:2006-08-23

    申请号:CN200410027316.6

    申请日:2004-05-26

    Abstract: 本发明公开了一种基因芯片表面的处理方法,该处理方法首先采用硅烷化试剂对玻片进行预处理;然后利用高分子聚合反应使丙烯酸和丙烯酰胺单体在玻片表面聚合,形成共价连接;在聚合反应发生的同时中引入活化分子,使其与聚合物中的酰胺基团发生化学反应,形成对氨基敏感的化学表面。用本发明方法处理的芯片表面具有稳定性好、固定效率高、操作流程简单、处理成本低的特点。

    一种消减杂交文库构建方法

    公开(公告)号:CN1542138A

    公开(公告)日:2004-11-03

    申请号:CN200310112066.1

    申请日:2003-11-07

    Abstract: 本发明公开了一种消减杂交文库构建方法,该方法包括以下步骤:(1)消减杂交装置的制备;(2)检测组和驱动组的酶切;(3)驱动组的固定;(4)检测组连接接头;(5)进行消减杂交;(6)消减产物的分组扩增;(7)消减杂交文库的构建。与传统的物理消减杂交方法相比,本发明具有以下优点:1)消减杂交装置成本低,制作简单;2)尼龙膜与核酸分子以共价键结合,结合牢固;3)在杂交过程中可控制杂交温度和时间;4)可根据需要控制杂交轮次;5)洗脱体积可按需要控制在数十微升,便于进一步的操作;6)试验操作简单,可重复性好;7)在消减杂交后进行PCR,避免了假阳性的出现;8)消减后进行分组PCR,可使低丰度的差异表达cDNA扩增。

Patent Agency Ranking