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公开(公告)号：CN118983005A
公开(公告)日：2024-11-19
申请号：CN202411063176.1
申请日：2024-08-05
申请人： 广东省农业科学院水稻研究所
IPC分类号： G16B20/30 , G16B40/00 , G06N3/042 , G06N3/0464 , G06N3/08
摘要： 本发明公开了一种植物表型多组学预测方法，包括：构建包括转录组预测模块、第一输出模块、基因组预测模块、第二输出模块和综合训练模块的多组学表型预测模型；获取植物的SNP数据和基因表达数据并进行预处理，对应得到SNP特征和基因表达特征；将基因表达特征输入至转录组预测模块，得到转录组数据特征；将转录组数据特征输入至第一输出模块，得到第一预测表型；将SNP特征输入至基因组预测模块，得到基因组数据特征；将基因组数据特征输入至第二输出模块，得到第二预测表型；将转录组数据特征和基因组数据特征连接后输入至综合训练模块，得到第三预测表型。结合基因网络和深度学习的方法有望克服现有方法的局限，进一步提升植物表型预测精度。
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公开(公告)号：CN118326080B
公开(公告)日：2024-10-22
申请号：CN202410764779.8
申请日：2024-06-14
申请人： 广东省农业科学院水稻研究所
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/113 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/46
摘要： 本发明涉及基因工程技术领域，尤其涉及一种miR528在调控稻米食味品质中的应用。本发明通过对miR528的生物学功能的研究，发现其调控叶片衰老相关的靶基因TPS2和SOD，分别在糖代谢和清除ROS途径两个角度，调控叶片生理功能，影响了叶片衰老过程，间接提高稻米食味品质，叶片是光合产物的主要场所，miR528可以调控叶片生理功能，影响籽粒中淀粉、直链淀粉和蛋白质等主要物质的含量，进而影响稻米的食味品质。
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公开(公告)号：CN118600065A
公开(公告)日：2024-09-06
申请号：CN202410409646.9
申请日：2024-04-07
申请人： 广东省农业科学院水稻研究所
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种用于广谱稻瘟病抗性基因完全连锁的分子标记，该分子标记包括1对广谱稻瘟病抗性ptr完全连锁基因的PCR标记引物：GTTGAGCACTTTGCTGGTGA和GCAACTTACAGGCATGCAGA；分析方法包括以下步骤：S1：合成引物：将设好的引物序列，应用DNA合成仪合成设计好的引物；S2：DNA提取和PCR扩增：利用设计的引物和提取的DNA模板；S3：扩增产物的检测；S4：数据的采集与分析。本发明通过PCR标记引物的设计，可以开发出ptr基因完全连锁的分子标记，且分子标记有效提高了育种过程中性状选择的效率和准确性，利用分子标记辅助选择能显著提高育种效。
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公开(公告)号：CN115044700B
公开(公告)日：2024-09-03
申请号：CN202210743806.4
申请日：2022-06-27
申请人： 岭南现代农业科学与技术广东省实验室 , 广东省农业科学院水稻研究所 , 中国水稻研究所
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了水稻抽穗期QTL qHd1功能标记及其应用，属于水稻种质资源鉴定及分子生物学技术领域；水稻抽穗期QTL qHd1共显性功能标记包括如下引物：1F：SEQ ID NO.1；2F：SEQ ID NO.2；1R：SEQ ID NO.3；3F：SEQ ID NO.4；3R：SEQ ID NO.5。本发明利用5条引物在同一PCR反应体系中通过常规PCR和琼脂糖凝胶电泳，可准确鉴定出插入型、缺失型、晶4155S型和杂合型基因型，结合品种籼/粳类型亦可鉴定出ZS97型和粳稻型两种单倍型；整个检测过程的操作简单，对不同来源的种质资源的鉴定结果准确性高。
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公开(公告)号：CN118290552A
公开(公告)日：2024-07-05
申请号：CN202410222983.7
申请日：2024-02-28
申请人： 广东省农业科学院水稻研究所
IPC分类号： C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/46
摘要： 本发明公开了一个提高水稻营养生长期和生殖生长期耐热的基因及其应用。所述提高水稻耐热性的基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明首次确定敲除LOC_Os12g39180基因可以降低水稻的耐热性，而过量表达LOC_Os12g39180可以提高水稻的耐热性，因此，本发明为提高水稻耐热的水稻种质资源改良/遗传育种提供了技术支持。
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公开(公告)号：CN118278819A
公开(公告)日：2024-07-02
申请号：CN202410487889.4
申请日：2024-04-22
申请人： 广东省农业科学院水稻研究所
IPC分类号： G06Q10/0639 , G06Q50/02
摘要： 本发明公开了一种区域农业发展潜力评价方法及系统，包括以下步骤：S1、构建区域农业发展潜力评价指标体系；S2、无量纲化处理所述区域农业发展潜力评价指标体系；S3、采用层次分析法对上一步得到的指标的权重进行赋值，确定评价因子综合权重；S4、确定评价对象的农业发展潜力。本发明根据农业发展潜力评价指标体系，以市级单元收集数据，计算各市的农业发展潜力；采用本发明的方法不仅有利于制定针对性的发展策略，且采用层次分析法来赋权，提高了区域农业发展潜力评价指标体系的科学性和实用性，可以在一定程度上更加客观的表示农业发展潜力。
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公开(公告)号：CN118116451A
公开(公告)日：2024-05-31
申请号：CN202410286173.8
申请日：2024-03-13
申请人： 广东省农业科学院水稻研究所
摘要： 本发明公开了一种基于重测序的InDel背景分子标记设计方法及应用，包括数据预处理模块、变异位点筛选模块、引物设计模块和背景分子标记开发模块。本发明实现了基于重测序数据，在全基因组范围内鉴定和筛选InDe l标记，并进行引物设计和背景分子标记开发，具有操作灵活、自动化程度高和批量高效等优点。本发明基于样本的重测序数据设计背景分子标记，与传统的基于参考基因组设计引物相比，引物特异性更强、密度更高、数量更多。本发明创新性使用划窗对InDel变异进行筛选，统一了每个窗口只允许存在一个InDel标记，减少了基于参考基因组直接寻找变异位点的不确定性，保证了背景分子标记的可靠性和基因分型能力。
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公开(公告)号：CN117965613A
公开(公告)日：2024-05-03
申请号：CN202410312555.3
申请日：2024-03-19
申请人： 广东省农业科学院水稻研究所
摘要： 本发明公开了一种水稻基因LTN9的应用，涉及水稻分子育种技术领域。本发明水稻叶片厚度调控基因LTN9位于水稻第9染色体长臂端，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，过表达该基因获得的转基因植株叶厚显著增加。利用该基因对水稻进行改良，可以提高水稻叶片厚度，提升水稻光合作用能力，进一步实现增产目标。
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公开(公告)号：CN117802125A
公开(公告)日：2024-04-02
申请号：CN202311847754.6
申请日：2023-12-29
申请人： 广东省农业科学院水稻研究所
摘要： 本发明公开了与作物种子胚乳合成茶氨酸相关的基因及应用，属于基因工程领域。本发明根据育种作物的密码子偏好性，优化AlaDC和TS的基因序列，利用连接肽连接两个基因片段后获得融合基因I，与育种作物胚乳强表达启动子融合，构建基因表达盒I；将AlaAT与育种作物胚乳强表达启动子融合，构建基因表达盒II；将基因表达盒I和基因表达盒II转入表达载体构建多基因重组载体；将多基因重组载体导入育种作物，获得种子胚乳能合成茶氨酸的转基因作物。本发明实现茶氨酸在作物(尤其是水稻)种子胚乳中的合成，其产品即可以直接用于食用，也可以作为生产茶氨酸的原料，对于新型功能性作物育种具有重要的指导意义和生产应用价值。
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公开(公告)号：CN117305311A
公开(公告)日：2023-12-29
申请号：CN202311088273.1
申请日：2023-08-25
申请人： 广东省农业科学院水稻研究所
摘要： 本发明属于生物技术领域，公开了水熊虫Dsup基因在水稻中异源表达提高水稻耐辐射能力中应用，具体公开了一种核酸分子，所述核酸分子如SEQ ID ON:2所示。相对于过去通过研究水稻体内已有的DNA修复基因、抗辐射基因的功能与分子机理研究来说，本发明另辟蹊径，创新地提出将外源Dsup基因转入水稻组成性表达，探究Dsup基因在异源环境下能否类似细胞系那样在异源条件增强物种的抗辐射能力，并且挖掘这种抗辐射能力的具体表现。实验表明Dsup基因异源表达植株与没有异源表达Dsup基因的水稻相比，具有更强的抗辐射能力、耐盐和耐热能力。
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