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公开(公告)号：CN105861686A
公开(公告)日：2016-08-17
申请号：CN201610298347.8
申请日：2016-05-06
Applicant: 上海交通大学
CPC classification number: C12Q1/6883 , C12Q2600/106 , C12Q2600/156
Abstract: 基于rs2032582的检测氯氮平用药效果的试剂盒及其使用方法，本发明涉及一种基因技术领域的ABCB1基因第八号外显子的单核苷酸多态性的检测方法。本发明涉及一种分离的含单核苷酸多态性位点的核苷酸，所述核苷酸的序列如SEQ ID NO:1所示，所述单核苷酸多态性位点位于第3169位，rs2032582为C→T。本发明涉及一种检测前述核苷酸的方法，包括如下步骤：步骤一，检测如SEQ ID NO：1所示序列的第3169位的核苷酸；步骤二，采用Taqman?MGB分型方法，检测第3169位否存在单核苷酸多态性。本发明为研究ABCB1基因多态性与临床用药安全的关系奠定了基础，为临床用药个体化提供理论基础，同时也为基于药物基因组学理念的新药研发提供指导依据。
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公开(公告)号：CN103150467B
公开(公告)日：2016-05-11
申请号：CN201310045029.7
申请日：2013-02-05
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种通过基因组表达谱检测药物不良反应的方法，包括：查询确认已知能够引起特定不良反应的药物，即风险药物；统计风险药物引起不良反应的发生频率；使用风险药物和目标药物分别处理人类或动物细胞系，并通过基因组表达芯片技术平台获得细胞系的全基因组表达谱；计算目标药物与各风险药物在基因组表达谱上的相似度，并根据风险药物的不良反应相对发生频率对表达谱相似度进行加权计算，从而对目标药物引起不良反应的风险进行打分判断。本发明的检测方法可通用于所有药物品种，不受药物种类的限制；该检测方法简单易操作，在不以实际人身伤害为代价的前提下，间接预计目标药物的不良反应风险，对临床药物风险评估有着良好的应用前景。
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公开(公告)号：CN103150467A
公开(公告)日：2013-06-12
申请号：CN201310045029.7
申请日：2013-02-05
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种通过基因组表达谱检测药物不良反应的方法，包括：查询确认已知能够引起特定不良反应的药物，即风险药物；统计风险药物引起不良反应的发生频率；使用风险药物和目标药物分别处理人类或动物细胞系，并通过基因组表达芯片技术平台获得细胞系的全基因组表达谱；计算目标药物与各风险药物在基因组表达谱上的相似度，并根据风险药物的不良反应相对发生频率对表达谱相似度进行加权计算，从而对目标药物引起不良反应的风险进行打分判断。本发明的检测方法可通用于所有药物品种，不受药物种类的限制；该检测方法简单易操作，在不以实际人身伤害为代价的前提下，间接预计目标药物的不良反应风险，对临床药物风险评估有着良好的应用前景。
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公开(公告)号：CN102719538A
公开(公告)日：2012-10-10
申请号：CN201210185423.6
申请日：2012-06-07
Applicant: 上海交通大学 , 同济大学附属第一妇婴保健院
Abstract: 本发明涉及一种基因诊断技术领域的非侵入性产前诊断高危遗传性耳聋的基因芯片及制备方法；所述基因芯片包括片基以及固定在片基上的探针，所述探针为SEQ IDNO.1～24所示的核苷酸序列；所述基因芯片的使用方法包括如下步骤：制备样品，多重PCR扩增，连接酶检测反应，芯片杂交，芯片扫描，获得结果；同时，本发明还涉及包含所述基因芯片的试剂盒；本发明的诊断芯片操作步骤简单，只需要进行一次多重PCR反应和连接酶反应，杂交扫描即可；检测特异性高，稳定性好，该芯片可正确区分各个位点的纯合子和杂合子，多次试验重复性高；检测时间短；采用通用芯片技术，片基也可通用于其他芯片，成本低。
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公开(公告)号：CN102559872A
公开(公告)日：2012-07-11
申请号：CN201110410178.X
申请日：2011-12-09
Applicant: 上海交通大学 , 复旦大学附属妇产科医院
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及一种检测Angelman综合征的基因芯片及使用方法、试剂盒，所述基因芯片包括固相载体和固定在该固相载体上的探针，所述寡核苷酸探针为SEQ ID NO.1-50所示的核苷酸序列；所述使用方法包括如下步骤：(a)制备样品DNA片段；(b)荧光标记上述DNA片段；(c)洗脱上述标记产物；(d)将标记产物与所述基因芯片杂交；(e)扫描检测基因芯片的杂交信号，获得结果；本发明还涉及包含前述基因芯片的试剂盒。本发明的基因芯片操作步骤简单，检测特异性高，稳定性好，从样本抽提到得到扫描结果可在一个工作日内完成，成本低，适用于临床患者基因突变检测、产前诊断和正常人杂合子携带者检测。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN102199668A
公开(公告)日：2011-09-28
申请号：CN201110095717.5
申请日：2011-04-15
Applicant: 上海交通大学 , 上海佰真生物科技有限公司
Abstract: 一种生物遗传技术领域的纳米颗粒分子单倍型分型方法，以待测样本的基因组DNA为模板，用对应目的DNA片段中的SNP等位基因的正向等位基因特异性引物和反向通用引物，通过长片段AuNP ASPCR处理实现目的DNA片段的染色单体的分离和扩增。本发明创新地在ASPCR体系中加入AuNP，有效的提高了单倍型分型的特异性；得到的单倍体PCR产物可直接用于SNP基因分型，如TaqMan探针和测序等，来获得待测两倍体个体的一个单倍型。待测样本的另一个单倍型可以用同样的方法得到，或者从基因型来推测。
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公开(公告)号：CN101974625A
公开(公告)日：2011-02-16
申请号：CN201010503018.5
申请日：2010-10-12
Applicant: 上海交通大学 , 上海佰真生物科技有限公司
IPC: C12Q1/68
Abstract: 一种一种纳米技术领域的生物素-亲和素系统检测单核苷酸多态性的方法。包括如下步骤：利用DNA折纸术构造一个非对称二维图形，制备DNA折纸芯片；末端修饰生物素的报告探针与DNA折纸芯片杂交；链霉亲和素与生物素连接；单核苷酸多态性检测；原子力显微镜成像；本发明具有无需严格的实验条件和复杂的酶反应，同时既简单，又低成本等优点。通过本发明可以在纳米尺度、液相反应中实现DNA杂交过程，实现高灵敏的生物医学检测。
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公开(公告)号：CN101948927A
公开(公告)日：2011-01-19
申请号：CN201010503080.4
申请日：2010-10-12
Applicant: 上海交通大学 , 上海佰真生物科技有限公司
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/68 , C12Q2563/155
Abstract: 一种纳米技术领域的纳米颗粒在DNA折纸芯片上的可控分布方法。该方法为三种方案的任一种：一、构造一个非对称二维图形，制备DNA折纸芯片，制备胶体金探针，粒径胶体金探针与非对称二维图形DNA折纸芯片连接，原子力显微镜成像；二、构造一个非对称二维图形，制备DNA折纸芯片，制备胶体金探针，DNA短链与胶体金探针杂交，粒径胶体金探针与非对称二维图形DNA折纸芯片连接，原子力显微镜成像；三、构造一个非对称二维图形，制备DNA折纸芯片，制备胶体金探针，DNA短链与胶体金探针杂交，粒径胶体金探针与非对称二维图形DNA折纸芯片连接，原子力显微镜成像，本发明在极微量生化检测芯片研制，纳米器件开发，纳米粒子基本性质研究等学科领域具有广泛的应用空间。
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公开(公告)号：CN100365118C
公开(公告)日：2008-01-30
申请号：CN200510026204.3
申请日：2005-05-26
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一组生物技术的精神分裂症相关核酸序列。包括：它具有SEQ IDNO：1-12所示的序列，单核苷酸多态性是在第26为存在G，在其DNA互补链上为A等位位点；单核苷酸多态性是在第26为存在C，在其DNA互补链上为T等位位点。本发明所提供的一组12种核酸序列可用于分析人类基因组上述单核苷酸多态性位点，将大大提高对精神分裂症的诊断和对个体是否具有精神分裂症易感性进行评判。同时上述核酸序列等位位点还可以作为药物设计靶点来进行药物的筛选，构建对精神分裂症进行遗传学诊断的试剂盒。
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公开(公告)号：CN101109018A
公开(公告)日：2008-01-23
申请号：CN200710041726.X
申请日：2007-06-07
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种CYP2D6基因第九号外显子的单核苷酸多态性的检测方法，同时涉及一种分离核酸、一种等位基因特异性的核酸引物。方法包括：确定在人CYP2D6基因第九号外显子的SEQ ID NO：1所示序列的第1322位的核苷酸；检测在所述位置是否存在单核苷酸多态性；一种分离核酸，具有SEQ ID NO：1所示的序列，且第1322位为A；一种等位基因特异性的核酸引物，其长度为15－50bp，且特异性地杂交并扩增出含人CYP2D6基因的第九号外显子的SEQ IDNO：1所示序列的第1322位的单核苷酸多态性的扩增产物。本发明可用于研究我国人群中CYP2D6基因多态性与临床用药安全的关系，为新药研发提供指导依据。
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