一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的核心SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN105779581A

    公开(公告)日:2016-07-20

    申请号:CN201510837629.6

    申请日:2015-11-26

    CPC classification number: C12Q1/6895 C12Q2600/156

    Abstract: 本发明公开了一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的核心SNP标记及其应用。本发明基于10个白菜核心资源的重测序,发掘了白菜全基因组的序列变异,筛选了一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的96组SNP核心引物。本发明的96组SNP核心引物具有较高的多态性信息量、最小等位基因频率以及较低的期望杂合度,能够准确的对329份商业品种进行鉴别,并且基因分型结果稳定。本发明提供的SNP位点和检测方法可应用于大白菜的遗传多样性分析和品种核酸指纹库构建等研究,可为新品种的特异性、一致性、稳定性检测体系的建立和新品种保护提供技术支持。同时,可建立对大白菜品种的高通量、低成本和标准化的检测体系。

    一种获得大白菜雄性不育系的方法

    公开(公告)号:CN101627723A

    公开(公告)日:2010-01-20

    申请号:CN200810116694.X

    申请日:2008-07-15

    Abstract: 本发明公开了一种获得大白菜雄性不育系的方法。该方法包括以下步骤:1)以芸薹属异源六倍体(AABBCC,n=27)秋引2005-12为母本,以含有A基因组(AA,n=10)的春种大白菜金春为父本进行杂交,获得杂交一代;所述芸薹属异源六倍体(AABBCC,n=27)秋引2005-12的保藏登记号为CGMCC № 2553;2)以含有A基因组(AA,n=10)的中晚熟大白菜义和五号为母本,以上述步骤1)获得的杂交一代为父本进行杂交,获得大白菜雄性不育系。实验证明,采用上述方法进行两次重复实验,结果每次都能获得大白菜雄性不育系,在11株大白菜中,有11株不育,不育株率为100%,不育度为100%。

    与大白菜桔红心性状紧密连锁的特征序列扩增标记及其获得方法

    公开(公告)号:CN1262653C

    公开(公告)日:2006-07-05

    申请号:CN03157031.3

    申请日:2003-09-11

    Abstract: 本发明公开了一种与大白菜桔红心性状紧密连锁的特征序列扩增标记,其DNA序列见序列表中SEQ ID NO:1序列。其获得方法包括:1)提取基因组DNA,使用RAPD随机引物对基因组DNA进行PCR反应,对PCR产物进行电泳分析;通过BSA法,寻找与桔红心性状连锁的RAPD标记,测定连锁距离并验证连锁关系。2)对与桔红心性状连锁的RAPD产物进行回收、克隆和测序,根据测序结果的两端序列设计引物对,长度20个碱基,用SCAR引物进行PCR扩增反应,对反应产物进行电泳分析,测定连锁距离并验证连锁关系。本发明的优点是:获得的SCAR标记具有分析程序简单、周期短、所需DNA量极少(一般为5-25ng)且质量要求不苛刻;设备简单;与其他标记类型相比,成本低,重复性好,标记稳定可靠,便于统计。

    与大白菜桔红心性状紧密连锁的特征序列扩增标记及其获得方法

    公开(公告)号:CN1594588A

    公开(公告)日:2005-03-16

    申请号:CN03157031.3

    申请日:2003-09-11

    Abstract: 本发明公开了一种与大白菜桔红心性状紧密连锁的特征序列扩增标记,其DNA序列见序列表中SEQ ID NO:1序列。其获得方法包括:1)提取基因组DNA,使用RAPD随机引物对基因组DNA进行PCR反应,对PCR产物进行电泳分析;通过BSA法,寻找与桔红心性状连锁的RAPD标记,测定连锁距离并验证连锁关系。2)对与桔红心性状连锁的RAPD产物进行回收、克隆和测序,根据测序结果的两端序列设计引物对,长度20个碱基,用SCAR引物进行PCR扩增反应,对反应产物进行电泳分析,测定连锁距离并验证连锁关系。本发明的优点是:获得的SCAR标记具有分析程序简单、周期短、所需DNA量极少(一般为5-25ng)且质量要求不苛刻;设备简单;与其他标记类型相比,成本低,重复性好,标记稳定可靠,便于统计。

    用于白菜种质资源多样性分析及分子育种的SNP组合及其应用

    公开(公告)号:CN106460063B

    公开(公告)日:2019-05-21

    申请号:CN201580030487.0

    申请日:2015-11-26

    CPC classification number: C12Q1/68

    Abstract: 本发明公开了一种用于白菜遗传多样性分析及分子育种的SNP组合及其应用。本发明所提供的应用具体为571个SNP位点或用于检测所述571个SNP位点的物质在如下任一中的应用:(1)构建白菜DNA指纹数据库;(2)白菜种质资源遗传多样性分析和/或进化分析;(3)白菜分子育种;所述571个SNP位点的物理位置是基于白菜品种Chiifu‑402‑2的全基因组序列比对确定的,所述白菜品种Chiifu‑402‑2的全基因组序列的版本号为V1.5;所述571个SNP位点是BrSNPA01001‑BrSNPA10043。实验证明,这571个SNP位点能够应用于白菜遗传多样性分析、进化分析;同时这571个SNP位点还可用于白菜分子育种,为其提供重要的技术支撑。

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