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公开(公告)号:CN105779581A
公开(公告)日:2016-07-20
申请号:CN201510837629.6
申请日:2015-11-26
Applicant: 北京市农林科学院
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开了一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的核心SNP标记及其应用。本发明基于10个白菜核心资源的重测序,发掘了白菜全基因组的序列变异,筛选了一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的96组SNP核心引物。本发明的96组SNP核心引物具有较高的多态性信息量、最小等位基因频率以及较低的期望杂合度,能够准确的对329份商业品种进行鉴别,并且基因分型结果稳定。本发明提供的SNP位点和检测方法可应用于大白菜的遗传多样性分析和品种核酸指纹库构建等研究,可为新品种的特异性、一致性、稳定性检测体系的建立和新品种保护提供技术支持。同时,可建立对大白菜品种的高通量、低成本和标准化的检测体系。
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公开(公告)号:CN105506163A
公开(公告)日:2016-04-20
申请号:CN201610072885.5
申请日:2016-02-02
Applicant: 北京市农林科学院
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156 , C12Q2600/172
Abstract: 本发明公开了一种鉴定控制白菜紫色性状形成的SNP分子标记及其应用。A0331593020T/A位点在如下A-F任一中的应用:A、在鉴别或辅助鉴别大白菜颜色中的应用;B、在选育紫色大白菜品种中的应用;C、大白菜育种中的应用;D、预测大白菜颜色中的应用;E、在制备鉴别或辅助鉴别大白菜颜色产品中的应用;F、在制备预测大白菜颜色产品中的应用。本发明通过实验证明,利用A0331593020T/A位点及其所对应的引物无论在紫色还是在绿色材料中的选择准确率均为100%。表明该位点及其所对应的引物将有助于紫色大白菜种质资源的筛选,为大白菜紫色性状的遗传改良提供材料储备和技术支持。
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公开(公告)号:CN105238869A
公开(公告)日:2016-01-13
申请号:CN201510769744.4
申请日:2015-11-11
Applicant: 北京市农林科学院
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开了基于竞争性等位基因特异性PCR技术的FLC1特异SNP分子标记及应用,本发明提供了检测白菜基因组中FLC1-13859895G/ASNP位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定白菜的抽薹状态中的应用。本发明的实验证明了,开发的SNP标记特异引物可以对抽薹性状良好分型,具有良好的应用价值,可实现对抗抽薹遗传材料的预先选择和辅助育种。
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公开(公告)号:CN101627723A
公开(公告)日:2010-01-20
申请号:CN200810116694.X
申请日:2008-07-15
Applicant: 北京市农林科学院
Abstract: 本发明公开了一种获得大白菜雄性不育系的方法。该方法包括以下步骤:1)以芸薹属异源六倍体(AABBCC,n=27)秋引2005-12为母本,以含有A基因组(AA,n=10)的春种大白菜金春为父本进行杂交,获得杂交一代;所述芸薹属异源六倍体(AABBCC,n=27)秋引2005-12的保藏登记号为CGMCC № 2553;2)以含有A基因组(AA,n=10)的中晚熟大白菜义和五号为母本,以上述步骤1)获得的杂交一代为父本进行杂交,获得大白菜雄性不育系。实验证明,采用上述方法进行两次重复实验,结果每次都能获得大白菜雄性不育系,在11株大白菜中,有11株不育,不育株率为100%,不育度为100%。
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公开(公告)号:CN1262653C
公开(公告)日:2006-07-05
申请号:CN03157031.3
申请日:2003-09-11
Applicant: 北京市农林科学院
Abstract: 本发明公开了一种与大白菜桔红心性状紧密连锁的特征序列扩增标记,其DNA序列见序列表中SEQ ID NO:1序列。其获得方法包括:1)提取基因组DNA,使用RAPD随机引物对基因组DNA进行PCR反应,对PCR产物进行电泳分析;通过BSA法,寻找与桔红心性状连锁的RAPD标记,测定连锁距离并验证连锁关系。2)对与桔红心性状连锁的RAPD产物进行回收、克隆和测序,根据测序结果的两端序列设计引物对,长度20个碱基,用SCAR引物进行PCR扩增反应,对反应产物进行电泳分析,测定连锁距离并验证连锁关系。本发明的优点是:获得的SCAR标记具有分析程序简单、周期短、所需DNA量极少(一般为5-25ng)且质量要求不苛刻;设备简单;与其他标记类型相比,成本低,重复性好,标记稳定可靠,便于统计。
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公开(公告)号:CN1594588A
公开(公告)日:2005-03-16
申请号:CN03157031.3
申请日:2003-09-11
Applicant: 北京市农林科学院
Abstract: 本发明公开了一种与大白菜桔红心性状紧密连锁的特征序列扩增标记,其DNA序列见序列表中SEQ ID NO:1序列。其获得方法包括:1)提取基因组DNA,使用RAPD随机引物对基因组DNA进行PCR反应,对PCR产物进行电泳分析;通过BSA法,寻找与桔红心性状连锁的RAPD标记,测定连锁距离并验证连锁关系。2)对与桔红心性状连锁的RAPD产物进行回收、克隆和测序,根据测序结果的两端序列设计引物对,长度20个碱基,用SCAR引物进行PCR扩增反应,对反应产物进行电泳分析,测定连锁距离并验证连锁关系。本发明的优点是:获得的SCAR标记具有分析程序简单、周期短、所需DNA量极少(一般为5-25ng)且质量要求不苛刻;设备简单;与其他标记类型相比,成本低,重复性好,标记稳定可靠,便于统计。
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公开(公告)号:CN109609671B
公开(公告)日:2022-07-05
申请号:CN201811330354.7
申请日:2018-11-09
Applicant: 北京市农林科学院 , 京研益农(北京)种业科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于生物技术领域,具体涉及一种检测芸薹种蔬菜叶缘裂刻性状的SNP分子标记及其应用。所述SNP分子标记选自:(a)Bra009510基因的模板链第358位核酸多态性为G或A;(b)芸薹种蔬菜保持叶全缘性状品种中与Bra009510同源的同源基因中,与SEQ ID NO.1第358位相对应的核酸多态性为G,和/或芸薹种叶缘裂刻性状品种中与Bra009510同源的同源基因中,与SEQ ID NO.1第358位相对应的核酸多态性为A;所述芸薹种蔬菜保持叶全缘性状品种和/或芸薹种蔬菜叶缘裂刻性状品种选自:自然界的品种、杂交品种、人工诱变品种;其中,所述Bra009510基因的模板链的序列如SEQ ID NO.1所示。利用本发明所提供的分子标记及其所对应的引物无论在叶缘裂刻还是在全缘材料中的选择准确率均为100%,可用于分子标记辅助选择育种。
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公开(公告)号:CN108118100B
公开(公告)日:2021-03-05
申请号:CN201810108752.8
申请日:2018-02-02
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种鉴定控制白菜叶片低温黄化性状形成的SNP分子标记及其应用。本发明提供的SNP位点为白菜基因组中的序列表中序列4自5’端第300位核苷酸,为T/G多态。本发明通过白菜F2群体的QTL定位,获得了1个与白菜低温黄化紧密连锁的主效QTL,进一步在此区间发开出1个与白菜低温黄化紧密连锁的SNP标记,通过对F2群体1881个单株验证发现标记的准确率能达到95.9%,该标记完全可用于白菜耐低温分子标记辅助育种。本发明获得的分子标记在实际应用中成本低、通量高、特异性高,为加速白菜耐低温育种提供了高效的辅助育种方法和技术。
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公开(公告)号:CN110734999A
公开(公告)日:2020-01-31
申请号:CN201911098565.7
申请日:2019-11-12
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种大白菜抗根肿病新基因CRw紧密连锁的SNP分子标记及应用。本发明提供了双侧分子标记(BVRC-A03033590标记和BVRC-A03035160标记)。BVRC-A03033590标记相应的SNP位点及其周边序列如序列表的序列4所示(SNP位点为序列4的第101位,命名为SNP位点甲,为T/A多态)。BVRC-A03035160标记相应的SNP位点及其周边序列如序列表的序列8所示(SNP位点为序列8的第101位,命名为SNP位点乙,为T/A多态)。两个标记可以联合或者单独使用,用于大白菜抗根肿病分子标记辅助育种。本发明的应用将对加快大白菜抗根肿病育种进程起到重要作用。
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公开(公告)号:CN106460063B
公开(公告)日:2019-05-21
申请号:CN201580030487.0
申请日:2015-11-26
Applicant: 北京市农林科学院
CPC classification number: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种用于白菜遗传多样性分析及分子育种的SNP组合及其应用。本发明所提供的应用具体为571个SNP位点或用于检测所述571个SNP位点的物质在如下任一中的应用:(1)构建白菜DNA指纹数据库;(2)白菜种质资源遗传多样性分析和/或进化分析;(3)白菜分子育种;所述571个SNP位点的物理位置是基于白菜品种Chiifu‑402‑2的全基因组序列比对确定的,所述白菜品种Chiifu‑402‑2的全基因组序列的版本号为V1.5;所述571个SNP位点是BrSNPA01001‑BrSNPA10043。实验证明,这571个SNP位点能够应用于白菜遗传多样性分析、进化分析;同时这571个SNP位点还可用于白菜分子育种,为其提供重要的技术支撑。
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