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公开(公告)号：CN110951893B
公开(公告)日：2022-10-25
申请号：CN201911397830.1
申请日：2019-12-30
Applicant: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及与肌内脂肪相关的分子标记以及肌内脂肪含量的检测方法。本发明利用10×Genomics单细胞RNA测序技术检测不同发育阶段的鸡肌肉细胞和肌内脂肪细胞的转录组，筛选获得肌内脂肪组织特异性表达基因，进一步进行原位表达验证和扩群验证，证明ENSGALG00000036073可作为肌内脂肪组织的特异性分子标记。ENSGALG00000036073可用于鉴定肌内脂肪组织以及评价肌内脂肪含量，具有较高的特异性和准确性，对于培育具有优良肉品质性状的家禽品种和肉品质的改良具有重要意义。
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公开(公告)号：CN113549699A
公开(公告)日：2021-10-26
申请号：CN202110744654.5
申请日：2021-07-01
Applicant: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11 , G16B20/00
Abstract: 本发明提供一种白羽肉鸡产蛋数的基因组选择方法，利用整合显著SNP标记效应的一步法全基因组育种值(GEBV)估计方法，对白羽肉鸡产蛋数进行GEBV估计。本发明还提供与白羽肉鸡产蛋数显著相关的SNP标记及其应用。包括标记rs317316870、rs313925951、rs14786427、rs14756086和rs316455929。本发明提供的具有低产蛋数白羽肉鸡品系的选育方法，与常规一步法GEBV估计结果相比，选择准确性可提高8.1％，即可缩短新品系育成的时间，节约选育的成本，提高育种效率，加快我国白羽肉鸡自主品系培育进程。
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公开(公告)号：CN108486103B
公开(公告)日：2021-10-19
申请号：CN201810282562.8
申请日：2018-04-02
Applicant: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
IPC: C12N15/11 , C12Q1/6876 , G01N33/68 , A61K45/00 , A61P31/16
Abstract: 本发明以禽流感H5N1A/Chicken/ShanXi/2/2006毒株cDNA为素材，利用亲和纯化‑质谱技术(AP‑MS)，开展了病毒‑宿主蛋白互作组的研究，发现宿主蛋白STAU2可以与H5N1禽流感病毒蛋白NS1相互作用，并且可以调节H5N1禽流感病毒的复制，当STAU2蛋白表达量高，则H5N1病毒复制效率高，反之，当STAU2蛋白表达量低，则H5N1病毒复制效率显著下降。在此基础上，本发明提供了STAU2蛋白在调节H5N1禽流感病毒复制中的应用，以及具体的应用手段和应用对象。为H5N1型禽流感病毒的预防、控制、和治疗提供了有力的科学依据和操作方法，具有重大的意义和价值。
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公开(公告)号：CN111225986B
公开(公告)日：2021-02-05
申请号：CN201780023241.X
申请日：2017-10-10
Applicant: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种鸡全基因组SNP芯片及其应用，该芯片上的SNP位点共50000个：分别源于中国主要地方品种和引进品种鸡的全基因组重测序信息，筛选出白羽肉鸡、黄羽肉鸡和麻羽肉鸡中具有MAF＞0.05，且在基因组平均分布的1.96万个SNP位点；与经济性状相关联的1.4万个SNP位点；弥补前两类探针未覆盖的基因组区域的1.64万个SNP位点。
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公开(公告)号：CN111225986A
公开(公告)日：2020-06-02
申请号：CN201780023241.X
申请日：2017-10-10
Applicant: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种鸡全基因组SNP芯片及其应用，该芯片上的SNP位点共50000个：分别源于中国主要地方品种和引进品种鸡的全基因组重测序信息，筛选出白羽肉鸡、黄羽肉鸡和麻羽肉鸡中具有MAF＞0.05，且在基因组平均分布的1.96万个SNP位点；与经济性状相关联的1.4万个SNP位点；弥补前两类探针未覆盖的基因组区域的1.64万个SNP位点。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN105087584A
公开(公告)日：2015-11-25
申请号：CN201510494475.5
申请日：2015-08-12
Applicant: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
IPC: C12N15/113 , C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及分子标记领域，具体提供一种与鸡腹脂沉积相关的miRNA及其应用。本发明利用高通量测序技术和miRNA-mRNA联合分析，筛选到调控脂肪沉积关键基因ACSL1的一种miRNA，所述的miRNA为gga-miR-19b-3p，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。所述miRNA可作为与鸡腹脂沉积相关的分子标记，在遗传辅助育种中具有重要的实际应用价值。
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公开(公告)号：CN103374629B
公开(公告)日：2014-08-06
申请号：CN201210133458.5
申请日：2012-04-28
Applicant: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明提供了一种利用微卫星标记鉴定北京油鸡的方法，该方法是以待测鸡的基因组为模板，以5’-TGCGGAGAGCAATTAGTCTGC-3’和5’-GGAAAACAATCACTGCCTCG-3’为引物，对LEI0070微卫星座位进行PCR扩增及测序，根据测序结果，统计该微卫星座位上各等位基因的频率，如果大小为201bp、205bp和207bp的3种等位基因频率之和在75％以上即鉴定为北京油鸡。该方法具有操作简便、检测费用低廉和准确性高的特点。
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公开(公告)号：CN103374629A
公开(公告)日：2013-10-30
申请号：CN201210133458.5
申请日：2012-04-28
Applicant: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明提供了一种利用微卫星标记鉴定北京油鸡的方法，该方法是以待测鸡的基因组为模板，以5’-TGCGGAGAGCAATTAGTCTGC-3’和5’-GGAAAACAATCACTGCCTCG-3’为引物，对LEI0070微卫星座位进行PCR扩增及测序，根据测序结果，统计该微卫星座位上各等位基因的频率，如果大小为201bp、205bp和207bp的3种等位基因频率之和在75％以上即鉴定为北京油鸡。该方法具有操作简便、检测费用低廉和准确性高的特点。
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公开(公告)号：CN119020497A
公开(公告)日：2024-11-26
申请号：CN202410820845.9
申请日：2024-06-24
Applicant: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及遗传育种和分子生物学领域，提供一套用于鉴定北京油鸡品种的SNP标记组合及其应用。本发明利用19个各类型鸡品种/品系全基因重测序数据进行单位点群体分化指数分析，以MEAN_FAST≥0.80为筛选标准，初步筛选得到候选SNP标记，利用连锁不平衡分析确定候选SNP标记集合，然后通过随机森林算法分析确定最终7个SNPs标记作为北京油鸡品种特征性标记集合，其中7个位点优势等位基因频率皆高于82.5％，利用这些位点将北京油鸡与其它代表性品种区分。本发明提供的SNP标记可作为北京油鸡品种鉴定的标记集合，在品种鉴定、保种和育种技术开发中具有重要的实际应用价值。
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公开(公告)号：CN118711656A
公开(公告)日：2024-09-27
申请号：CN202411198976.4
申请日：2024-08-29
Applicant: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
Abstract: 本发明涉及生物信息学领域，本发明提供一种基因组选择方法、装置、设备、介质及计算机程序产品，包括：对目标畜禽的盲肠内容物样本进行微生物基因测序，得到与RFI相关的ASVs；对目标畜禽进行全基因组范围的SNP位点分型，得到分型结果；基于基因矩阵G对应的第一权重、微生物矩阵M对应的第二权重、ASVs以及分型结果构建权重亲缘关系GM矩阵；G是基于分型结果构建的，M是基于目标畜禽的各ASV的相对丰度构建的；基于目标相对权重对应的GM矩阵进行育种值估计，根据估计的育种值对目标畜禽进行育种；目标相对权重是基于第一权重和第二权重确定的。本发明提高了估计畜禽饲料利用率的相关性状育种值的准确性。
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