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公开(公告)号：CN116519778A
公开(公告)日：2023-08-01
申请号：CN202310324870.3
申请日：2023-03-29
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/626
Abstract: 本发明公开了一种基于干血清片的癌症代谢诊断装置及其性能评估方法，涉及医疗领域，包括干血清片、质谱仪、机器学习模块，所述干血清片在萃取后与纳米颗粒耦合，通过纳米材料辅助激光解吸电离质谱获得的代谢指纹谱图，并通过机器学习算法获得诊断性能。通过比较与相应血清样本在相同的气体、温度和时间段内的代谢指纹谱图来判断诊断装置的稳定性能。本发明使得纳米颗粒增强激光解吸/电离质谱进行干基质点分析成为可能，能够在癌症诊断方面得到有效应用，从而减轻液体样本的储存负担，降低诊断成本。
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公开(公告)号：CN116297799A
公开(公告)日：2023-06-23
申请号：CN202310109934.8
申请日：2023-02-14
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
IPC: G01N27/626 , G01N33/68
Abstract: 一种用于代谢综合征及其临床前期诊断的血浆小分子代谢生物标志物，由如下的物质组成：嘧啶，(S)‑β‑氨基异丁酸，3‑羟基丁酸，L‑丝氨酸，胍乙酸，3‑羟基异戊酸，L‑高丝氨酸，L‑半胱氨酸，哌啶酸，次牛磺酸，肌酸酐，苯乙酸，赤藓糖醇，吡啶甲酸，牛磺酸，焦谷氨酸，柠檬康酸，苹果酸，酪胺，异烟酸，邻磷酸乙醇胺，L‑谷氨酰胺，水杨酸，D‑葡萄糖。本发明还提供了检测上述血浆小分子代谢生物标志物组合物的试剂盒，检测获得血浆小分子代谢生物标志物的谱峰强度，通过计算每个受试者是否为MetS或pre‑MetS的危险性得分，然后预测受试者是否为MetS或pre‑MetS。本发明实现了对代谢综合征及其临床前期的高效快速诊断。
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公开(公告)号：CN116106401A
公开(公告)日：2023-05-12
申请号：CN202310126440.0
申请日：2023-02-16
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种生物标志物组合及其筛选方法，涉及生物技术领域。生物标志物组合包括乳酸、谷氨酰胺、高精氨酸和3‑甲基戊烯酸，应用于脑动脉瘤的破裂风险评估。生物标志物组合的筛选方法：使用纳米颗粒增强激光解吸/电离质谱采集脑动脉瘤患者和健康对照组血清的代谢指纹；进行机器学习，筛选生物标志物组合。本发明利用纳米颗粒增强激光解吸/电离质谱筛选出乳酸、谷氨酰胺、高精氨酸和3‑甲基戊烯酸为代谢生物标志物，并将标志物用于脑动脉瘤的破裂风险评估，低风险组与高风险组有显著差异(P值
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公开(公告)号：CN115440379A
公开(公告)日：2022-12-06
申请号：CN202211174833.0
申请日：2022-09-26
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种多模态癌症识别装置及应用，涉及医学人工智能领域，该装置包括数据输入模块、特征处理模块和定量分析模块；其中，输入模块的输出作为所述特征处理模块的输入，特征处理模块的输出作为所述定量分析模块的输入，定量分析模块采用定量分析网络计算癌症的概率。该装置在代谢指纹图谱和临床检测标志物的数据分析中的应用。提供了一种基于代谢指纹图谱和临床检测标志物的多模态癌症识别方法、装置、计算设备和应用，结合代谢以及代谢的正交信息准确识别早期癌症，快速判别癌症相关的代谢标志物，为癌症早筛、标志物筛选提供更好的解决方案。
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公开(公告)号：CN113484405B
公开(公告)日：2022-10-11
申请号：CN202110756337.5
申请日：2021-07-05
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种亚微反应器的制备方法，包括如下步骤：步骤2.1：将3‑氨基苯酚APF溶解于去离子水中，并加入甲醛溶液和氨水溶液；步骤2.2：将步骤2.1的混合物在30℃条件下，反应30分钟；步骤2.3：将步骤2.2中的反应物进行离心洗涤，得到APF亚微材料。本发明还提供一种基于上述的亚微反应器的血清代谢物检测方法。本发明提供的亚微反应器作为基质材料，可以应用于小分子的检测，如氨基酸和糖醇类，可以克服传统基质的缺陷，快速、高通量、高灵敏度地对血清进行检测。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN115144519A
公开(公告)日：2022-10-04
申请号：CN202210767302.6
申请日：2022-06-30
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基于无机纳米颗粒的单细胞样品指纹图谱检测方法和应用，涉及分析检测技术领域。其中检测方法包括以下步骤：步骤1：制备氧化铁微纳颗粒基质；步骤2：向含有生物小分子的单细胞样品中喷加所述氧化铁微纳颗粒基质，制成待分析样品；步骤3：对所述待分析样品的指纹图谱进行MALDI质谱检测；步骤4：对MALDI质谱检测结果进行分析，得出结论。本发明的检测方法灵敏度高、成本低、检测通量高，满足了在单细胞水平对代谢组进行高通量指纹图谱的获取需求，能揭示细胞间的异质性，在对生物体生长发育以及致病机理等过程进行单细胞水平的深入解读方面具有重大应用潜力。
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公开(公告)号：CN113484404A
公开(公告)日：2021-10-08
申请号：CN202110751014.7
申请日：2021-07-02
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/64
Abstract: 本发明公开了一种金属有机框架材料的制备方法及其小分子检测应用，涉及金属有机框架材料领域，制备方法包括将二甲基甲酰胺，乙醇，去离子水，三乙胺，对苯二甲酸混合加入一密闭容器中，并加入金属氯化物形成混合物；然后水浴超声后离心并洗涤；接着分散在去离子水中，采用低速离心分离出超薄金属有机框架材料；并应用于小分子检测中。本方法可以对金属有机框架材料中金属离子和厚度进行精准调节，实现了克服传统基质的缺陷，样本量低、快速、高通量、高灵敏度地对血清小分子进行检测。
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公开(公告)号：CN112418072A
公开(公告)日：2021-02-26
申请号：CN202011308746.0
申请日：2020-11-20
Applicant: 上海交通大学 , 腾讯科技(深圳)有限公司
IPC: G06K9/00
Abstract: 本申请涉及一种数据处理方法、装置、计算机设备和存储介质。所述方法涉及谱图数据的预处理技术领域，所述方法包括：获取实验样本对应的原始谱图；对原始谱图进行等采样处理，获得质荷比统一的谱图；对质荷比统一的谱图进行去噪处理，获得去噪谱图；根据参考谱图中的谱图峰对去噪谱图进行谱图校正，得到校正后谱图；对校正后谱图进行谱图配准处理后，得到实验样本对应的预处理数据，预处理数据用于对实验样本进行成分分析。采用本方法能够极大地提升数据预处理效果，预处理数据可通过与机器学习方法结合的方式来分析代谢物信息，得出最终的生物化学解释。
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公开(公告)号：CN111896609A
公开(公告)日：2020-11-06
申请号：CN202010707525.4
申请日：2020-07-21
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/64
Abstract: 一种基于人工智能分析质谱数据的方法，方法包括：采用激光辅助解吸/电离质谱仪对每个所述样本进行代谢物小分子指纹谱图进行收集；将所述指纹图谱进行绝对强度的提取处理；将处理后的数据输入所述多层神经网络，进行样本分组处理。一种样本区分贡献重要性的计算方法，将指纹图谱数据转化为二维图像；使用显著性特征分析方法对所述代谢物筛选图片库内的数据进行计算，并对所有特征进行排序，筛选出对样本区分贡献最大的物质。本发明的有益效果是：对质谱数据实现样本快速分组，并大大提升了分类模型的可解释能力。
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公开(公告)号：CN106807308B
公开(公告)日：2020-05-26
申请号：CN201510862073.6
申请日：2015-11-30
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种核壳结构的磁性纳米粒子，该磁性纳米粒子的核为铁氧化物，壳为二氧化硅，磁性纳米粒子的表面用透明质酸钠修饰，经透明质酸钠修饰的磁性纳米粒子的粒径范围为350‑1000nm。本发明还公开了该磁性纳米粒子的制备方法及其在血清肿瘤标志物的提取和质谱检测中的应用。基于此合成的透明质酸钠修饰的磁性纳米粒子结合质谱技术可以快速实现血清肿瘤标志物如一些细胞表面跨膜糖蛋白的提取和部分序列鉴定，从而实现高分子量化合物高效、快速的检测。本发明作为一种快速高效的检测手段，值得推广和应用。
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