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公开(公告)号:CN106434932A
公开(公告)日:2017-02-22
申请号:CN201610886975.8
申请日:2016-10-11
Applicant: 贵州大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种鉴别地方猪品种的结构变异SV200分子标记,其特征在于:结构变异SV200位于猪参考基因组Sscrofa 10.2的chr 6:17953135-17953289,缺失片段长度为155bp,处于MMP-15基因内含子5中,结构变异SV200的缺失基因定义为D,正常不缺失的基因定义为A,5个地方猪品种D基因的频率显著高于大白猪相应值,可以作为鉴别地方猪品种的分子标记。
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公开(公告)号:CN112626231A
公开(公告)日:2021-04-09
申请号:CN202011547984.7
申请日:2020-12-24
Applicant: 贵州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种利用SMAD5基因中SV314分子标记区分中国地方猪品种与大白猪的检测技术,其特征在于:SV314位于猪参考基因组Sscrofa 11.1的chr2:138335008‑138335321(SMAD5基因的第4内含子中),缺失SV314的等位基因型定为D,正常不缺失等位基因型定为I。应用本发明所述的检测技术,得出大白猪以不缺失的I基因为主,而中国地方猪品种以缺失的D基因为主,应用分子标记SV314可以区分大白猪和中国地方猪品种。
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公开(公告)号:CN106244719B
公开(公告)日:2019-12-13
申请号:CN201610885885.7
申请日:2016-10-11
Applicant: 贵州大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种鉴别香猪品种的结构变异SV141分子标记,其特征在于:结构变异SV141位于猪参考基因组(Ssc 10.2)的chr14:81642733‑81643165,在MCU基因的内含子1内;该结构变异命名为D或A两种基因,三种基因型分别命名为DD、DA和AA型,香猪中D基因的频率显著高于其它6个猪品种,可以作为鉴别香猪品种的分子标记。
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公开(公告)号:CN106148522B
公开(公告)日:2019-12-13
申请号:CN201610533169.2
申请日:2016-07-08
Applicant: 贵州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与香猪产仔数相关的SV5标记,其特征在于:SV5标记是指猪基因组中,候选区域chr3:58983698‑58983852的结构变异,该区域缺失结构变异155bp片段,或不缺失。对香猪繁殖性状和结构的关联分析显示,SV5缺失或正常对其产仔数有显著影响,其中SV5缺失个体总产仔数显著高于SV5正常的个体(P<0.05)。
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公开(公告)号:CN110452996A
公开(公告)日:2019-11-15
申请号:CN201910819710.X
申请日:2019-08-31
Applicant: 贵州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与香猪产仔数相关的SV477标记及其检测方法,其特征在于:SV477结构变异较猪参考基因组(Sscrofa 11.1)缺失477bp,位于类叶酸5基因(Follistatin-like 5,FSTL5)内含子2中,区间为chr8:50916421-50916897。对香猪繁殖性状和结构的关联分析显示,SV477缺失或正常对其产仔数有显著影响,在所有胎次中,II型所对应的的产仔数最高,产仔数最低的是DD型。
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公开(公告)号:CN110373483A
公开(公告)日:2019-10-25
申请号:CN201910819725.6
申请日:2019-08-31
Applicant: 贵州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了提供一种与香猪产仔数相关的NELFA基因中SV40分子标记及应用,其特征在于:SV4结构变异较猪参考基因组(Sscrofa 11.1)缺失40bp,位于NELFA基因的内含子1中,区间为chr8:50916410-50916886。对香猪繁殖性状和结构的关联分析显示,SV40缺失或正常对其产仔数有显著影响,分析香猪的前3胎产仔数,发现II型所对应的的产仔数最高,产仔数最低的是DD型。
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公开(公告)号:CN110373481A
公开(公告)日:2019-10-25
申请号:CN201910819723.7
申请日:2019-08-31
Applicant: 贵州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种区分大白猪和贵州地方猪品种的结构变异SV91,其特征在于:结构变异较猪参考基因组(Sscrofa 11.1)插入91bp,位于WNT信号通路抑制因子2基因(Dickkopf WNT Signaling Pathway Inhibitor 2,DKK2)内含子1中,区间为chr8:114875181-114875271,SV91插入基因定为I,正常不插入的基因定为D。应用本发明所述的检测技术,检测样品的SV91基因型,发现大白猪只存在DI和II两种基因型并以插入的I等位基因为主。
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公开(公告)号:CN110343771A
公开(公告)日:2019-10-18
申请号:CN201910819952.9
申请日:2019-08-31
Applicant: 贵州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种鉴定香猪品种的结构变异SV322,其特征在于:SV322位于猪参考基因组Sscrofa 11.1的chrx:48700783-48702105,SV322缺失基因定为D,正常不缺失的基因定为I。应用本发明所述的检测技术,检测样品的SV322基因型,发现香猪只存在两种基因型既DD型和DI型,以DD型为主,等为基因频率D为97%,对于大白猪和黔北黑猪无纯合缺失型(DD)和杂合型(DI),只有正常型II型且等位基因频率D为0%。因此可应用结构变异SV322作为分子标记鉴定中国地方猪品种香猪。
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公开(公告)号:CN106434932B
公开(公告)日:2019-09-27
申请号:CN201610886975.8
申请日:2016-10-11
Applicant: 贵州大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种鉴别地方猪品种的结构变异SV200分子标记,其特征在于:结构变异SV200位于猪参考基因组Sscrofa 10.2的chr 6:17953135‑17953289,缺失片段长度为155bp,处于MMP‑15基因内含子5中,结构变异SV200的缺失基因定义为D,正常不缺失的基因定义为A,5个地方猪品种D基因的频率显著高于大白猪相应值,可以作为鉴别地方猪品种的分子标记。
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