一种鉴别地方猪品种的结构变异SV200分子标记

    公开(公告)号:CN106434932A

    公开(公告)日:2017-02-22

    申请号:CN201610886975.8

    申请日:2016-10-11

    Applicant: 贵州大学

    Abstract: 本发明公开了一种鉴别地方猪品种的结构变异SV200分子标记,其特征在于:结构变异SV200位于猪参考基因组Sscrofa 10.2的chr 6:17953135-17953289,缺失片段长度为155bp,处于MMP-15基因内含子5中,结构变异SV200的缺失基因定义为D,正常不缺失的基因定义为A,5个地方猪品种D基因的频率显著高于大白猪相应值,可以作为鉴别地方猪品种的分子标记。

    一种鉴别香猪品种的结构变异SV141分子标记及其应用

    公开(公告)号:CN106244719A

    公开(公告)日:2016-12-21

    申请号:CN201610885885.7

    申请日:2016-10-11

    Applicant: 贵州大学

    Abstract: 本发明公开了一种鉴别香猪品种的结构变异SV141分子标记,其特征在于:结构变异SV141位于猪参考基因组(Ssc 10.2)的chr14:81642733-81643165,在MCU基因的内含子1内;该结构变异命名为D或A两种基因,三种基因型分别命名为DD、DA和AA型,香猪中D基因的频率显著高于其它6个猪品种,可以作为鉴别香猪品种的分子标记。

    一种鉴别香猪品种的结构变异SV141分子标记及其应用

    公开(公告)号:CN106244719B

    公开(公告)日:2019-12-13

    申请号:CN201610885885.7

    申请日:2016-10-11

    Applicant: 贵州大学

    Abstract: 本发明公开了一种鉴别香猪品种的结构变异SV141分子标记,其特征在于:结构变异SV141位于猪参考基因组(Ssc 10.2)的chr14:81642733‑81643165,在MCU基因的内含子1内;该结构变异命名为D或A两种基因,三种基因型分别命名为DD、DA和AA型,香猪中D基因的频率显著高于其它6个猪品种,可以作为鉴别香猪品种的分子标记。

    一种与香猪产仔数相关的SV5标记及其检测方法

    公开(公告)号:CN106148522B

    公开(公告)日:2019-12-13

    申请号:CN201610533169.2

    申请日:2016-07-08

    Applicant: 贵州大学

    Abstract: 本发明公开了一种与香猪产仔数相关的SV5标记,其特征在于:SV5标记是指猪基因组中,候选区域chr3:58983698‑58983852的结构变异,该区域缺失结构变异155bp片段,或不缺失。对香猪繁殖性状和结构的关联分析显示,SV5缺失或正常对其产仔数有显著影响,其中SV5缺失个体总产仔数显著高于SV5正常的个体(P<0.05)。

    一种与香猪产仔数相关的NELFA基因中SV40分子标记及应用

    公开(公告)号:CN110373483A

    公开(公告)日:2019-10-25

    申请号:CN201910819725.6

    申请日:2019-08-31

    Applicant: 贵州大学

    Abstract: 本发明公开了提供一种与香猪产仔数相关的NELFA基因中SV40分子标记及应用,其特征在于:SV4结构变异较猪参考基因组(Sscrofa 11.1)缺失40bp,位于NELFA基因的内含子1中,区间为chr8:50916410-50916886。对香猪繁殖性状和结构的关联分析显示,SV40缺失或正常对其产仔数有显著影响,分析香猪的前3胎产仔数,发现II型所对应的的产仔数最高,产仔数最低的是DD型。

    一种用于鉴定中国地方猪种香猪的结构变异KLF8基因中SV322分子标记及其检测技术

    公开(公告)号:CN110343771A

    公开(公告)日:2019-10-18

    申请号:CN201910819952.9

    申请日:2019-08-31

    Applicant: 贵州大学

    Abstract: 本发明公开了一种鉴定香猪品种的结构变异SV322,其特征在于:SV322位于猪参考基因组Sscrofa 11.1的chrx:48700783-48702105,SV322缺失基因定为D,正常不缺失的基因定为I。应用本发明所述的检测技术,检测样品的SV322基因型,发现香猪只存在两种基因型既DD型和DI型,以DD型为主,等为基因频率D为97%,对于大白猪和黔北黑猪无纯合缺失型(DD)和杂合型(DI),只有正常型II型且等位基因频率D为0%。因此可应用结构变异SV322作为分子标记鉴定中国地方猪品种香猪。

    一种鉴别地方猪品种的结构变异SV200分子标记

    公开(公告)号:CN106434932B

    公开(公告)日:2019-09-27

    申请号:CN201610886975.8

    申请日:2016-10-11

    Applicant: 贵州大学

    Abstract: 本发明公开了一种鉴别地方猪品种的结构变异SV200分子标记,其特征在于:结构变异SV200位于猪参考基因组Sscrofa 10.2的chr 6:17953135‑17953289,缺失片段长度为155bp,处于MMP‑15基因内含子5中,结构变异SV200的缺失基因定义为D,正常不缺失的基因定义为A,5个地方猪品种D基因的频率显著高于大白猪相应值,可以作为鉴别地方猪品种的分子标记。

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