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公开(公告)号:CN107849569B
公开(公告)日:2021-08-03
申请号:CN201580082101.0
申请日:2015-11-05
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
Abstract: 提供了一种肺腺癌相关生物标记物及其应用。还提供一种体外检测受试者存在肺腺癌的方法,包括:检测受试者的第一部位中的一种或者多种生物标记物上的突变水平,获得第一突变水平,所述生物标记物包括以下至少一种基因:TP53,EGFR,LRP1B,KRAS,PTPRD,STK11,SMAD2,PIK3CA,BRAF,FLT1,RHPN2,GLI3和MRC2;将第一突变水平与第一参考水平比较,当第一突变水平与第一参考水平具有显著差异时,判定受试者患有肺腺癌,第一参考水平为生物标记物在正常个体的第一部位中的突变水平。
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公开(公告)号:CN107077533B
公开(公告)日:2021-07-27
申请号:CN201480082793.4
申请日:2014-12-10
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
Abstract: 一种测序数据处理装置(100),装置包括:数据接收单元(10),用于接收所述测序数据,所述测序数据包括多对读段对,每对读段对由两个读段组成,分别来自一条染色体片段的两个位置,每个读段都包含缺口;处理器(20),用于执行数据处理程序,执行所述数据处理程序包括实现将所述测序数据与参考序列作比对,获得比对结果,以及消除所述比对结果中的每个读段的缺口,获得通用比对结果;以及,至少一个存储单元(30),用于存储数据,其中包括所述数据处理程序。还提供了一种测序数据处理系统、方法,一种计算机可读存储介质、一种检测CNV的方法及设备。
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公开(公告)号:CN113166815A
公开(公告)日:2021-07-23
申请号:CN201980076831.8
申请日:2019-02-22
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6886 , C12Q1/04 , G01N33/569 , G01N33/574
Abstract: 本发明公开了肠道宏基因组在预测PD‑1抗体阻断剂对于癌症的治疗效果中的用途以及用于预测PD‑1抗体阻断剂对非小细胞肺癌患者治疗效果的标志物及应用。该标志物包括选自Streptococcussanguinis,Escherichia coli,Clostridium sp.L2‑50,Citrobacter freundii,Pyramidobacter piscolens,及其类似物中的至少一种。
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公开(公告)号:CN112469733A
公开(公告)日:2021-03-09
申请号:CN201880095200.6
申请日:2018-07-12
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
IPC: C07K14/725 , C12N15/12 , C12N15/867 , C12N5/10 , A61P35/00
Abstract: 提供一种MART‑1(27‑35)表位特异性T细胞受体,该T细胞受体包含α链和β链;所述α链包含三个互补决定区,序列分别为SEQ ID No.3的第61‑66位、第84‑89位以及第124‑136位;所述β链包含三个互补决定区,氨基酸序列分别为SEQ ID No.4的第46‑50位、第68‑73位以及第112‑125位。提供表达TCR的T细胞可以有效的识别T2细胞负载的MART‑1(27‑35)表位多肽,并分泌IFN‑γ,证明其具有功能。该TCR与相关药物靶标联用,可以有效的进行药物开发。
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公开(公告)号:CN107077538B
公开(公告)日:2020-08-07
申请号:CN201480082792.X
申请日:2014-12-10
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
Abstract: 一种测序数据处理装置、系统和方法,一种计算机可读存储介质、一种检测SNP的方法及设备,其中,测序数据处理装置包括:数据接收单元(10),用于接收所述测序数据,所述测序数据包括多对读段对,每对读段对由两个读段组成,分别来自一条染色体片段的两个位置,每个读段都包含缺口;处理器(20),用于执行数据处理程序,执行所述数据处理程序包括实现将所述测序数据与参考序列作比对,获得比对结果,以及消除所述比对结果中的每个读段的缺口,获得通用比对结果;以及,至少一个存储单元(30),用于存储数据,其中包括所述数据处理程序。
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公开(公告)号:CN111164210A
公开(公告)日:2020-05-15
申请号:CN201780095498.6
申请日:2017-09-28
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
IPC: C12N15/11 , C12N15/10 , C40B50/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种扩增TCR全长序列的PCR引物对及其制备方法和应用,包括上游引物和下游引物:所述上游引物根据一段接头序列设计,所述接头序列通过接头引物TSO引入到第一链cDNA的3’端;所述下游引物根据TCR的C区设计。
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公开(公告)号:CN109971715A
公开(公告)日:2019-07-05
申请号:CN201711458709.6
申请日:2017-12-28
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
Abstract: 本发明公开了一种扩增特异性CAR‑T细胞的培养方法。本发明公开的扩增特异性CAR‑T细胞的培养方法,包括:1)向免疫细胞的培养体系中添加免疫细胞所识别的抗原,得到共培养体系;2)培养所述共培养体系,实现免疫细胞的扩增;免疫细胞为表达嵌合抗原受体的T细胞;共培养体系中免疫细胞与抗原的配比为106个:1~100ng。实验证明,利用本发明的扩增特异性CAR‑T细胞的培养方法得到的CAR‑T细胞的阳性率可提高4‑6倍,并且该方法操作简便、高效、特异性强,实用性强。
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公开(公告)号:CN114981288A
公开(公告)日:2022-08-30
申请号:CN202080094292.3
申请日:2020-07-27
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
Abstract: 提供一种多肽片段及其制备方法,所述多肽片段包含从N端至C端如X1X 2X 3X 4X 5GX 6所示的氨基酸序列,其中,X1为S、T、E、Y或F;X2为T、N、G、S或D;X3为H、E、Y、T、K、R或A;X4为G、Y、H、R或M;X5为A、F、Q、H、I或V;X6为W或F。还公开了编码该多肽的分离的核酸分子,并利用该多肽来制作针对PCSK9的多肽疫苗。该多肽片段可与抗PCSK9抗体结合,可检测、筛选或辅助筛选新的抗PCSK9抗体,从而缓解患者对原抗体出现免疫原性强等不良反应的问题。
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公开(公告)号:CN112469733B
公开(公告)日:2022-04-19
申请号:CN201880095200.6
申请日:2018-07-12
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
IPC: C07K14/725 , C12N15/12 , C12N15/867 , C12N5/10 , A61P35/00
Abstract: 提供一种MART‑1(27‑35)表位特异性T细胞受体,该T细胞受体包含α链和β链;所述α链包含三个互补决定区,序列分别为SEQ ID No.3的第61‑66位、第84‑89位以及第124‑136位;所述β链包含三个互补决定区,氨基酸序列分别为SEQ ID No.4的第46‑50位、第68‑73位以及第112‑125位。提供表达TCR的T细胞可以有效的识别T2细胞负载的MART‑1(27‑35)表位多肽,并分泌IFN‑γ,证明其具有功能。该TCR与相关药物靶标联用,可以有效的进行药物开发。
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公开(公告)号:CN113046392A
公开(公告)日:2021-06-29
申请号:CN201911379764.5
申请日:2019-12-27
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
IPC: C12N15/867 , C12N15/12 , A61K48/00 , A61K31/7088 , A61P7/06
Abstract: 本申请公开了一种治疗β‑球蛋白功能缺失的重组慢病毒载体及制备方法和应用。本申请的重组慢病毒载体,其基因元件由依序连接的左侧慢病毒长末端重复序列、慢病毒逆响应元件、中心多嘌呤序列、β‑球蛋白基因的基因座调控序列、第87位苏氨酸突变为谷氨酰胺的β‑球蛋白基因和右侧慢病毒长末端重复序列组成。本申请的重组慢病毒载体,通过基因元件的优化和改进,提高了基因转导效率,且在造血干细胞向红系分化过程中可以高效表达β‑球蛋白基因,从而可以有效降低病毒使用量,在增加安全性的同时,降低治疗成本。本申请的重组慢病毒载体为β‑球蛋白功能缺失导致的β‑地中海贫血和镰刀型贫血提供了一种新的治疗工具和方案。
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