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公开(公告)号:CN108198170B
公开(公告)日:2020-12-01
申请号:CN201711446060.6
申请日:2017-12-27
Applicant: 杭州筹图科技有限公司 , 首都医科大学附属北京友谊医院
Abstract: 本发明公开了一种纤维间隔的识别方法及装置,根据胶原图像和血管图像获得表征组织样本中面积大于第一阈值的胶原蛋白的位置分布的第一图像,以及表征组织样本中面积小于第一阈值,并且长度大于第二阈值的胶原蛋白的位置分布的第二图像,根据第一图像和第二图像获得胶原块图像,采用预设的决策树作为统一的标准,根据预设的决策树对胶原块图像中的各个胶原块进行分类,获得属于纤维间隔的胶原块,从而得到纤维间隔图像。采用上述纤维间隔的识别方案,一方面,无需对组织样本进行染色处理,减少识别过程中的干扰;另一方面,以预设的决策树作为统一的标准,避免人为识别带来的个体差异,所得的纤维间隔的识别结果稳定性高。
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公开(公告)号:CN108230387A
公开(公告)日:2018-06-29
申请号:CN201711476772.2
申请日:2017-12-29
Applicant: 杭州筹图科技有限公司 , 首都医科大学附属北京友谊医院
Abstract: 本发明公开了一种纤维间隔特征量化的方法及装置,获取组织样本的纤维间隔二值图像,纤维间隔二值图像用于表征纤维间隔在组织样本中的位置分布;识别纤维间隔二值图像中的每一个连通域,生成每一条纤维间隔的特征二值图像;根据每一条纤维间隔的特征二值图像,获得该纤维间隔的特征值,纤维间隔的特征包括面积,长度,以及宽度中的一种或多种。本发明实施例中,不仅提供了获得纤维间隔的特征值的方法,还提供了获得纤维间隔中,胶原蛋白束的特征值的方法,此外,还提供了获得纤维间隔中,非纤维化区域的特征值的方法。从而,实现对纤维间隔的特征进行量化,为就诊提供更直观的数据依据。
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公开(公告)号:CN116064765A
公开(公告)日:2023-05-05
申请号:CN202210918879.2
申请日:2022-08-02
Applicant: 首都医科大学附属北京友谊医院
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开检测LOXL1基因突变的物质在制备肝纤维化患者分子分型的产品中的应用。本发明公开了检测LOXL1基因突变的物质在制备肝纤维化患者分子分型的产品中的应用,所述LOXL1基因突变为LOXL1基因第一外显子从起始密码子ATG开始的第458位的核苷酸由G突变为A的杂合突变。本发明首次发现LOXL1基因458G>GA杂合突变与肝纤维化患者治疗后的肝纤维化不易逆转显著相关,基于该发现可快速对肝纤维化初治患者进行分子分型,以预判治疗后效果,有利于临床诊治过程中对肝纤维化患者更好地监督管理,适用于大样本肝纤维化患者分子分型的快速诊断筛查。
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公开(公告)号:CN115662622A
公开(公告)日:2023-01-31
申请号:CN202211445532.7
申请日:2022-11-18
Applicant: 首都医科大学附属北京友谊医院
Abstract: 本发明实施例公开一种肝纤维化分子分型系统,所述分子分型系统包括:特异基因集获取模块,用于从公共数据库中肝纤维化相关的转录组基因表达谱中筛选出不受病因扰动的肝纤维化细胞外基质组基因获得特异基因集;肝纤维化患者分子分型模块,用于基于所述特异基因集的整体表达水平,使用非监督的分层聚类法将待分类的肝纤维化患者分子分型为不同的风险等级。本方案基于大样本、多病因、相对独立的多个临床样本队列筛选出不受病因扰动的肝纤维化细胞外基质组基因,通过分层聚类法进行肝纤维化患者的分子分型,无需人为评价,具有较高的客观性。
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公开(公告)号:CN115453021A
公开(公告)日:2022-12-09
申请号:CN202210972568.4
申请日:2022-08-15
Applicant: 首都医科大学附属北京友谊医院
Abstract: 本发明公开一种SDS脱细胞溶液及其在脱细胞处理或细胞外基质不可溶组分鉴定中的应用。首先公开了一种SDS脱细胞溶液,由溶剂PBS溶液和溶质0.5M NaCl、1.5%SDS、0.1%Triton X‑100、0.1%Tween 20和1mM蛋白酶抑制剂混合物组成。进一步公开了其在脱细胞处理或细胞外基质不可溶组分鉴定中的应用。本发明脱细胞方法在SDS法脱细胞前,增加了冷冻/解冻三次循环以及针尖扎眼等步骤,另外利用优化的SDS脱细胞溶液,适用于小鼠整体器官或组织或小块组织的脱细胞,操作简便,且经济成本较低,脱细胞效果显著,最大限度提高了ECM组分的纯度,以后续蛋白质谱鉴定ECM不可溶组分。
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公开(公告)号:CN108198170A
公开(公告)日:2018-06-22
申请号:CN201711446060.6
申请日:2017-12-27
Applicant: 杭州筹图科技有限公司 , 首都医科大学附属北京友谊医院
CPC classification number: G06T7/0012 , G06T7/136 , G06T7/70 , G06T2207/30056 , G06T2207/30101
Abstract: 本发明公开了一种纤维间隔的识别方法及装置,根据胶原图像和血管图像获得表征组织样本中面积大于第一阈值的胶原蛋白的位置分布的第一图像,以及表征组织样本中面积小于第一阈值,并且长度大于第二阈值的胶原蛋白的位置分布的第二图像,根据第一图像和第二图像获得胶原块图像,采用预设的决策树作为统一的标准,根据预设的决策树对胶原块图像中的各个胶原块进行分类,获得属于纤维间隔的胶原块,从而得到纤维间隔图像。采用上述纤维间隔的识别方案,一方面,无需对组织样本进行染色处理,减少识别过程中的干扰;另一方面,以预设的决策树作为统一的标准,避免人为识别带来的个体差异,所得的纤维间隔的识别结果稳定性高。
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公开(公告)号:CN108185990A
公开(公告)日:2018-06-22
申请号:CN201711461539.7
申请日:2017-12-28
Applicant: 杭州筹图科技有限公司 , 首都医科大学附属北京友谊医院
IPC: A61B5/00
Abstract: 本发明公开了一种连接PT和CV的纤维间隔的识别方法及装置,获得第一图像,该第一图像表征未修正前的PT和CV在组织样本中的位置分布,获取第一图像中包括类血管结构的目标区域,根据每个目标区域中面积最大的血管,识别该目标区域中的纤维间隔,合并所有目标区域中的纤维间隔,获得纤维间隔图像。该纤维间隔图像,用于表征纤维间隔在未修正前的PT和CV之间的位置分布。从而,本发明开创性的提供了识别连接PT和CV的纤维间隔的有效的实现方案。
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公开(公告)号:CN102952751A
公开(公告)日:2013-03-06
申请号:CN201110242023.X
申请日:2011-08-23
Applicant: 首都医科大学附属北京友谊医院
Abstract: 本发明涉及一种多种细胞共培养支架,该支架包括支架面和与所述支架面连接的支撑架,所述的支架面上开设有固定孔。所述的支架面边缘处连接有支撑架。本发明可根据需要进行3到5种细胞的共同培养,可适用于多种贴壁细胞、悬浮或半悬浮细胞的共同培养。各种细胞分别生长于不同的培养小室或培养皿内,不会造成不同细胞之间的污染与混杂,易于收获细胞。
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公开(公告)号:CN102344903B
公开(公告)日:2012-11-28
申请号:CN201010240107.5
申请日:2010-07-29
Applicant: 首都医科大学附属北京友谊医院
Abstract: 本发明公开了一种成体大鼠肝脏卵圆细胞系rHOC,该细胞系已于2010年7月23日保存在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(CGMCC),其保藏登记编号为CGMCC No.4057。所述细胞具有以下生物学特性:细胞呈典型上皮细胞形态,具有较强的增殖能力但生长仍具有接触抑制与密度抑制现象,表达的肝脏前体细胞标志物:肝脏卵圆细胞标志物(OV-6)、Notch配基Delta样蛋白(Dlk)、甲胎蛋白(AFP)、白蛋白(ALB)和细胞角蛋白19(CK19);细胞连续传代培养48个月已传至100代,仍然保持上述形态特点、生长和增殖特性以及免疫表型,其特性稳定、成分均一,是良好的肝脏前体细胞研究模型。
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公开(公告)号:CN117402959A
公开(公告)日:2024-01-16
申请号:CN202311404053.5
申请日:2023-10-26
Applicant: 首都医科大学附属北京友谊医院
IPC: C12Q1/6883 , G01N33/68
Abstract: 本发明公开一种用于评估肝纤维化病因控制预后的基因标志物组合及其应用。本发明首先公开了用于评估肝纤维化病因控制预后的基因标志物组合,包括BUB1B、CDC45、CDT1、CHEK1、CLSPN、DEPDC1、E2F8、ECT2、KIF11、KIF18A、KIF4A、KIFC1、MKI67、ORC6、PARPBP、PBK、RRM2和TOP2A。进一步公开了上述基因标志物组合的表达水平的检测试剂在制备评估肝纤维化病因控制预后的试剂盒中的应用。本发明基因标志物组合的表达水平差异可用于预测初治患者在长期病因控制预后肝纤维化的逆转情况,进而对患者进行更好的临床诊治和监督管理,以期为更多的患者带来临床获益。
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