公开(公告)号：CN114121146A

公开(公告)日：2022-03-01

申请号：CN202111428461.5

申请日：2021-11-29

Applicant: 山东建筑大学

Inventor： 刘振栋 ,  杨玉荣 ,  李冬雁 ,  陈曦 ,  吕欣荣 ,  秦梦颖 ,  柏苛 ,  何志强 ,  李晓峰 ,  王少华 ,  胡国胜

IPC: G16B5/00 ,  G16B15/00

Abstract: 本发明公开了一种基于并行和蒙特卡罗策略的RNA三级结构预测方法，该方法属于结构预测领域。该方法包括利用并行机制进行构象空间采样；根据最新更新的能量函数进行打分；通过两轮势能评判对构象基于“Stepwise ansatz”的蒙特卡洛操作进行合理性判断；最后经过结构完整性和建模精度的判断，对结果进行处理，直到获得稳定的高精度高完整性的RNA三级结构。本发明所提RNA三级结构预测方法能够获得高精度高完整性的RNA三级结构。基于并行和蒙特卡罗策略的RNA三级结构预测方法灵活性高，蒙特卡罗次数可指定，建模精度和建模时间成本可以由用户来衡量；该方法克服了现有技术方法对RNA模体建模不完整的问题；本发明增加了构象采样的广度和深度，减小了伪最低自由能的影响，提高建模精度。