公开(公告)号：CN117512107A

公开(公告)日：2024-02-06

申请号：CN202311326619.7

申请日：2023-10-13

Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院

Inventor： 郭伟剑 ,  黄胜林 ,  杨亚男 ,  张洁筠 ,  张文 ,  王艺璇

IPC: C12Q1/6886 ,  G16B25/10 ,  G16H50/20 ,  G16H70/40

Abstract: 本发明提供了晚期结直肠癌奥沙利铂一线化疗疗效预测标志物组合，所述标志物组合由外泌体来源的22个基因组成。本发明还提供了同时预测晚期结直肠癌奥沙利铂和伊立替康化疗疗效的标志物组合，所述标志物组合由外泌体来源的7个基因组成。本发明基于上述标志物组合构建了化疗疗效预测模型，临床医生使用相应预测模型可以为患者选择更合适的治疗方案，实现个体化治疗。

公开(公告)号：CN117017962A

公开(公告)日：2023-11-10

申请号：CN202311072124.6

申请日：2023-08-23

Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院

Inventor： 胡治祥 ,  吴勇 ,  黄胜林 ,  吴小华 ,  陈思宇 ,  邵杨

IPC: A61K31/167 ,  A61K31/502 ,  A61P35/00

Abstract: 本发明提供了一种HDACI抑制剂辛二酰苯胺异羟肟酸(SAHA)在制备治疗卵巢癌药物中的用途,所述卵巢癌为对PARP抑制剂耐药的卵巢癌,所述PARP抑制剂为奥拉帕利。本发明通过一系列体内体外研究，证实HDACi抑制剂SAHA靶向抑制KLF5，发现SAHA联合PARP抑制剂奥拉帕利是高表达KLF5的卵巢癌患者PARP抑制剂耐药具有良好效果，具有良好的临床价值和市场价值。

公开(公告)号：CN110619926B

公开(公告)日：2023-03-31

申请号：CN201910726790.4

申请日：2019-08-07

Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院

Inventor： 黄胜林 ,  赵晶晶 ,  黎琴 ,  何祥火

IPC: G16B20/30 ,  G16B35/00

Abstract: 本发明提出了一种识别全部RNA剪切位点的分析方法，英文名称为Assembling Splice Junctions Analysis，简称ASJA，包括以下步骤：步骤A：ASJA算法识别全部的剪接事件的连接点，包括以下：步骤A1：对RNA‑seq数据进行比对以及产生拼接后的转录本；步骤A2：提取所有的剪接连接点，包括线性剪切位点、反式剪切位点和融合剪切位点；步骤A3：注释和整合所述剪接连接点；步骤B：评估ASJA的效能。本发明方法提供唯一识别剪接事件的位点以及对每种连接点的标准化定量。本发明的ASJA方法比现有方法运行速度快，且准确性高。本发明通过已经发表过的RNA‑seq数据进行进行评估，通过ASJA可以有效地分析检测和定量剪接连接点，同时也发现了新的剪接连接点。本发明还提出了一种识别全部RNA剪切位点的分析系统。

公开(公告)号：CN109763173A

公开(公告)日：2019-05-17

申请号：CN201910086801.7

申请日：2019-01-29

Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院

Inventor： 黄胜林 ,  何祥火 ,  王臻 ,  李焱 ,  李玉琛 ,  赵晶晶

IPC: C40B50/06 ,  C40B40/06 ,  C12Q1/6886

Abstract: 本发明公开了一种细胞外囊泡长链RNA文库及其构建方法，该构建方法包括如下步骤：血浆样品分离；血浆细胞外囊泡纯化；细胞外囊泡总RNA提取以及细胞外囊泡RNA测序文库构建和测序分析。本发明的一种血浆细胞外囊泡长链RNA文库的构建方法可从1ml血浆中稳定获得超过1万个RNA靶点，包括信使RNA、长链非编码RNA和环状RNA，可用于疾病的诊断，尤其是癌症病人的筛查和诊断。