一种基于甲基化数据筛选疾病标志物的方法

    公开(公告)号:CN117238373A

    公开(公告)日:2023-12-15

    申请号:CN202311140411.6

    申请日:2023-09-05

    Abstract: 本申请提供一种基于甲基化数据筛选疾病标志物的方法,包括:获得a个甲基化检测平台的多个样本的甲基化数据;对甲基化数据进行预处理;基于a个甲基化检测平台的经预处理后的甲基化数据,通过计算并筛选出每个甲基化检测平台中的差异区间;基于差异区间存在的甲基化检测平台的个数,对差异区间进行分类,将其分成w个类型;计算w个类型的特征值并基于该特征值来选取疾病标志物;a个甲基化检测平台的测序深度分别为M1~Ma,测序广度分别为L1~La,在M1~Ma中的最大值所在的甲基化检测平台与L1~La中的最大值所在的甲基化检测平台为不同的平台。

    一种癌症基因甲基化检测系统和在该系统在中执行的癌症体外检测方法

    公开(公告)号:CN115176034A

    公开(公告)日:2022-10-11

    申请号:CN202180016643.3

    申请日:2021-02-20

    Abstract: 本发明提供了一种用于检测癌症甲基化的系统,其包括:样品采集模块,其用于采集受试者样品;DNA提取模块,其用于提取纯化样品中的DNA;建库模块,其用于针对纯化的DNA样品构建用于测序的DNA文库;转化模块,其用于用重亚硫酸盐转化构建的DNA文库;预PCR扩增模块,其用于预PCR扩增经重亚硫酸盐转化的DNA文库;杂交捕获模块,其用于利用探针组合物对经预PCR扩增的样品进行杂交捕获;后PCR扩增模块,其用于利用PCR扩增经杂交捕获后的产物;测序模块,其用于对PCR扩增后的经杂交捕获后的产物进行高通量二代测序;数据分析模块,其用于对测序数据进行分析,确定样本的甲基化水平;判读模块,其用于基于样本的甲基化水平判读患者的患病情况。

    用于癌症筛查的系统及其方法
    19.
    发明公开

    公开(公告)号:CN114974430A

    公开(公告)日:2022-08-30

    申请号:CN202210182941.6

    申请日:2022-02-25

    Abstract: 本申请提供了一种用于癌症筛查的系统,其包括:数据采集模块,其用于获取受试者目标区域的甲基化水平、肿瘤分数、肿瘤倍性、cfDNA片段长度特征值和reads分布的数据;以及癌症计算模块,其基于数据采集模块中获取的甲基化水平、肿瘤分数、肿瘤倍性、cfDNA片段长度特征值和reads分布的数据以预测受试者罹患癌症的概率。本申请使用非常简单的模型,所用5个标志物能够大幅度地降低癌症筛查的成本并提高筛查准确率的癌症无创筛查方法,并具有非常高的灵敏度和特异性。

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