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公开(公告)号:CN105219852A
公开(公告)日:2016-01-06
申请号:CN201510622133.7
申请日:2015-09-25
Applicant: 南京大学
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q1/6851 , C12Q2531/113 , C12Q2545/101 , C12Q2563/107 , C12Q2561/113
Abstract: 本发明公开了一种检测鱼腥藻磷代谢相关酶基因表达量的引物及应用与方法,该引物为以下两对引物中的一对或两对,核苷酸序列为pstl-F:GCCACAGCTCAAGCTCAAAC;pstl-R:CCCACCACCACTACCAATCC;或phoAlike-F:GTGGCTGGAGCAAGAACTTA;phoAlike-R:CAGCATCTTGAGGGTTGTGT。本发明还提供了所述引物的应用,即通过检测鱼腥藻磷代谢相关酶基因表达量来测定水体生物有效磷含量;并开发了基于磷代谢相关酶基因表达量获得水体生物有效磷含量的测定方法,将为我国环境监测和管理部门在水体富营养化监测与水华爆发预警等领域的科技应用和技术提升提供坚实的基础。
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公开(公告)号:CN102925532A
公开(公告)日:2013-02-13
申请号:CN201210372540.3
申请日:2012-09-29
Applicant: 南京大学
Abstract: 一种基于活细胞矩阵技术的物质毒性的确定方法,属于物质毒性的确定方法。其步骤为:首先,测试环境毒物对大肠杆菌的生长抑制作用,求算环境毒物对细菌生长抑制的EC20;取出冻存有大肠杆菌的培养管或微孔板,融化,迅速转移复制入一块装有新鲜培养基的培养管或微孔板,培养细菌3个小时,将其分装入多孔微孔板;选择一个或多个测试浓度,在培养管或微孔板内快速加入受试环境毒物;将加过受试化合物的培养管或微孔板放入酶标仪,记录报告基因信号在此后随时间变化的情况。本发明可以提供高品质的基因表达数据;同时更快捷、简便,无需复杂的前处理过程;并且,具有很高的可重复性;成本低,可以最大程度的避免人为操作误差或干扰。
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公开(公告)号:CN119151754A
公开(公告)日:2024-12-17
申请号:CN202411640339.8
申请日:2024-11-18
Applicant: 南京大学
IPC: G06Q50/26 , G01N33/18 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于时空序列环境DNA数据的流域污染溯源方法,属于环境科学和生态监测技术领域。包括以下步骤:获取空间上eDNA样品和水质信息;获取关键断面时间上的eDNA样品和水质信息;对本地污染源进行采样,获取污染源的排放数据;对样品进行eDNA提取与高通量测序,建立空间、时间和本地污染源的DNA指纹数据库;对获取的数据进行一次溯源分析,识别主要的污染源类型;对获取的数据进行二次溯源分析,确定特定污染源对水质波动的贡献。本发明构建了污染源公共数据库指导下的本地污染源筛查技术,融合了人工智能模型的环境DNA二次溯源方法,能在复杂的流域环境中实现高效、精准的污染源识别与量化。
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公开(公告)号:CN113005208B
公开(公告)日:2024-03-19
申请号:CN202110481643.2
申请日:2021-04-30
Applicant: 南京大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于DNA检测技术领域,公开了一种软体动物通用宏条形码扩增引物及其应用方法。本发明的方法依据常见软体18S基因序列设计了6条宏条形码扩增引物,包括3条上游引物和3条下游引物,该引物对软体动物群落覆盖度广、扩增效率高,引物组合可以扩增出长度为200bp至350bp的产物,兼容不同高通量测序平台,这种多引物组合的方法可以降低非特异性扩增,提高PCR成功率,可广泛用作特征条码序列进行软体动物物种鉴定、软体动物多样性分析等研究。
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公开(公告)号:CN113393131B
公开(公告)日:2024-01-30
申请号:CN202110675797.5
申请日:2021-06-18
Applicant: 南京大学
IPC: G06Q10/0639 , C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12N15/11 , G06Q50/26
Abstract: 本发明公开了一种基于环境DNA宏条形码监测数据,对淡水生态系统的浮游植物进行生物完整性评价的方法,属于生物技术领域。本发明基于环境DNA宏条形码监测浮游植物的结果,设计了包含(1)参考点和受损点确定;(2)环境DNA样品采集;(3)eDNA宏条形码生物监测;(4)基于eDNA宏条形码监测的候选生物指标定义及计算;物生物完整性得分;(7)划分健康等级等一系列监测与评价流程,为淡水浮游植物的生态完整性评价提供了完整且易于操作的指导,可广泛应用于溪流、河流、湖泊和水库等淡水生态系统的浮游植物完整性评价和水生态健康状况评估。(5)候选指数筛选;(6)选定生物指标计算浮游植
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公开(公告)号:CN110415770B
公开(公告)日:2022-05-17
申请号:CN201910788995.5
申请日:2019-08-26
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种基于剂量‑效应简化转录组预测化学品胚胎发育毒性的计算方法,属于预测毒理学领域。本发明通过系统地整合高通量测试数据进行打分计算,来预测化学品胚胎毒性,并识别化学品的关键毒性机制。本发明的计算方法以关键事件(KE)间相关证据为依据,利用剂量‑效应简化转录组等高通量分子测试数据对斑马鱼发育相关的有害结局路径(AOP)进行激活打分计算。本发明比传统的胚胎发育毒性测试更加高效、更加敏感,实现了高效的基于化学品致毒机制的毒性预测,可以通过低剂量化学品对早期胚胎转录水平的影响来预测更长生命阶段的发育毒性效应,识别化学品的致毒机制,区分不同致毒模式的化学品。
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公开(公告)号:CN113005208A
公开(公告)日:2021-06-22
申请号:CN202110481643.2
申请日:2021-04-30
Applicant: 南京大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于DNA检测技术领域,公开了一种软体动物通用宏条形码扩增引物及其应用方法。本发明的方法依据常见软体18S基因序列设计了6条宏条形码扩增引物,包括3条上游引物和3条下游引物,该引物对软体动物群落覆盖度广、扩增效率高,引物组合可以扩增出长度为200bp至350bp的产物,兼容不同高通量测序平台,这种多引物组合的方法可以降低非特异性扩增,提高PCR成功率,可广泛用作特征条码序列进行软体动物物种鉴定、软体动物多样性分析等研究。
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公开(公告)号:CN105424415B
公开(公告)日:2018-02-13
申请号:CN201510766516.1
申请日:2015-11-11
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种水生生物样品在线自动采集及保存装置,该装置由控制单元、支架、进样单元、分配单元和收集单元组成。本发明装置通过PLC编程,能够根据预设参数自动运行所有动作实现精确采样,自动化程度高,采样效率快,且节省人力、物力成本;本发明装置采用深度传感器实现了对采样深度的精确控制,能够对不同深度的水体进行分层采样,使得检测水样的环境更接近自然环境;本发明装置通过定量控制蠕动泵的运转时间,实现对滤水量的精确控制,克服了现有大多数技术滤水量误差较大的问题;本发明装置除了能自动采集样品外,还具备现场定量添加固定剂功能,提高了所采样品的稳定性。
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公开(公告)号:CN104915698A
公开(公告)日:2015-09-16
申请号:CN201510220542.4
申请日:2015-05-04
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了化学品安全信息快速查询和全周期追踪数码标签系统,属于信息编码技术领域。本发明首先对化学品按照《全球化学品统一分类和标签制度》危险分类等信息进行整合归类,结合化学品的身份信息,建立化学品安全信息数据库,对化学品信息进行编码,化学品编码信息用制作成标签;标签附着于化学品包装上;使用终端对标签上的化学品编码进行录入;终端显示此化学品危险分类等信息,对化学品开展在线追踪。它可以实现化学品标签信息占据的存储空间小,识别速度快,可以在流通中全程追踪化学品信息。
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公开(公告)号:CN104404160A
公开(公告)日:2015-03-11
申请号:CN201410748206.2
申请日:2014-12-09
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种MIT引物设计方法和利用高通量测序构建浮游动物条形码数据库的方法,属于生物技术领域。本发明设计的MIT引物由测序接头序列、8-12个碱基的barcode序列和常规PCR引物组成;本发明中利用高通量测序构建浮游动物条形码数据库的方法包括:单个体裂解法提取DNA、线粒体DNA(MIT)引物PCR扩增、PCR扩增产物纯化及定量、高通量测序和序列分析,本方法采用特殊的MIT引物,避免了测序文库的构建,通过高通量测序可一次性的获得大量的条形码序列,操作方便,快速,经济,便于推广应用,能高效的构建各种动物条形码数据库。
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