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公开(公告)号:CN115272282A
公开(公告)日:2022-11-01
申请号:CN202210988269.X
申请日:2022-08-17
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明涉及一种OCT手指图像智能分层方法、设备、介质及产品,该方法包括以下步骤:对手指OCT图像进行预处理;标注预处理后的OCT图像层次边界并以生成层次区域的方式产生标注样本,通过标注样本生成训练集、验证集与测试集;构建基础网络,构建与基础网络编码部分结构一致的并行特征学习网络进行多级上下文信息聚合,并且在基础网络解码部分引出多级网络输出用于构造多级损失函数;对OCT图像进行分区域配置损失函数权重的多级损失函数计算;利用训练好的模型结构与参数,对经过预处理的OCT图像进行层次分割并计算层次厚度。本发明能更准确地实现手指OCT图像两侧组织层次分割,同时能够减少误分割的小区域,减少预测边界断裂现象。
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公开(公告)号:CN114331805A
公开(公告)日:2022-04-12
申请号:CN202111611454.9
申请日:2021-12-27
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明公开一种基于GPU的OCT成像方法及系统,方法包括步骤:CPU主机端分配固定内存;GPU设备端获取GPU变量并对其进行单次设备初始化;重复GPU变量获取和单次设备初始化,直至停止采集;显示图像;GPU设备端采用C++类的析构函数完成GPU设备内存的自动释放;单次设备初始化包括:采用构造函数分配GPU设备内存;创建第一异步流绑定cuFFT plan,创建第二异步流绑定cuFFT plan;将每一帧数据分为第一帧和第二帧;第一异步流对应第一帧、第二异步流对应第二帧并行交替执行数据传入、数据处理以及传出图像数据。本发明通过对CPU端分配固定内存进行内存优化管理,利用异步流构架结合C++类的成员函数,实现CPU和GPU的异步运行,实现MHz高速的OCT图像实时处理。
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公开(公告)号:CN109407327A
公开(公告)日:2019-03-01
申请号:CN201811306921.5
申请日:2018-11-05
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种多位点双光子光刺激系统及其刺激方法,该系统包括飞秒激光器、分束模块、第一聚焦模块及自聚焦透镜。本发明还公开了一种多位点双光子光刺激方法,包括以下步骤:飞秒激光器发出飞秒激光,并传输至分束模块,形成多束多个方向的飞秒激光;再经低倍物镜或长焦距透镜进行第一次聚焦,然后再传输至各个刺激位点前的自聚焦透镜进行二次聚焦,最后聚焦于各个刺激位点。本发明通过低倍物镜(或长焦距透镜)和多个自聚焦透镜的组合实现二次聚焦,将飞秒激光引导到多个刺激位点,在三维大范围内的多个位点实现双光子光刺激,又不降低光刺激激发效率;本发明使得数字孔径大幅提高,又能有效地将飞秒激光引导至各个刺激位点上。
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公开(公告)号:CN103543277B
公开(公告)日:2016-03-16
申请号:CN201310416614.3
申请日:2013-09-13
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: G01N33/80
Abstract: 本发明公开了一种基于灰度分析与种类识别的血型结果识别算法,它包括以下步骤:灰度变换、平滑滤波、倾斜校正、微柱小管分割、阈值处理、灰度分析、种类识别、对比检测结果,本发明采用灰度分析与种类识别相结合的方法对血型检测结果进行自动识别,提高了血型检测结果识别的效率,具有快速准确的优点,同时通过抖动消除、倾斜校正、微柱小管分割、种类识别等操作,提高了结果识别的有效性。
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公开(公告)号:CN113796832B
公开(公告)日:2024-11-19
申请号:CN202111047059.2
申请日:2021-09-07
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种全景旋转内窥双光子显微成像系统,包括:近红外飞秒脉冲激光器、主机、成像探头组件和轴向扫描装置,所述成像探头组件包括旋转输出单元以及旋转驱动单元;所述旋转输出单元植入到动物的脑组织中,用于将飞秒脉冲激光导入脑组织,并收集脑组织被激发而产生的荧光。本发明将高速旋转扫描与微型内窥双光子成像系统结合,提出了一种能特别适用于灵长类较大型动物的全景内窥双光子显微成像系统,通过将成像探头组件的旋转输出单元置入到脑组织,藉由360度环形柱面扫描能实现所观察脑区内360度全景成像,藉由轴向扫描进行不同深度的探测,能实现从深脑区到脑皮层管道所覆盖连续多个脑功能区的神经活动观测。
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公开(公告)号:CN113655026B
公开(公告)日:2024-01-23
申请号:CN202110897601.7
申请日:2021-08-05
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: G01N21/359 , G01N21/19 , G01N21/64 , G02B21/00 , G02B21/04
Abstract: 本发明公开了一种椭半球曲面大视野高通量双光子显微镜,包括:近红外飞秒脉冲激光器联组、分束延时模块联组、扫描单元联组、合束拼接模块、椭球曲面大视野反射式物镜、二向色片和光电倍增管探测阵列。本发明通过反射式物镜的设计来实现椭圆曲面大视野,能将平面矩形的激光扫描场转换成椭圆半球面的激光扫描场;通过采用多路激光并行扫描和多路荧光并行的探测方式能实现高通量扫描,利用四色原理,将不相邻区域划分为一组,利用区域间隙和合并式半波片最大化多次偏振合束的能量效率;不组激光之间引入延时,通过同时点的区域不相邻、相邻的区域不同时的方案,在时间和空间上能有效区(56)对比文件ANDRES FLORES VALLE等.Two-photonBessel beam tomography for fast volumeimaging.optics express.2019,1-16.
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公开(公告)号:CN117395223A
公开(公告)日:2024-01-12
申请号:CN202311505002.1
申请日:2023-11-13
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: H04L61/103 , H04L61/5007 , H04L69/16
Abstract: 本发明提供基于RDMA的多通道高通量双光子显微镜数据传输方法及系统,针对多通道高通量双光子显微镜数据实时传输,在显微镜子服务器与主服务器上分别安装RDMA板卡,子服务器与主服务器的RDMA板卡通过万兆交换机进行互联,并分配RDMA网卡的I P地址,设置子服务器为发送端,主服务器为接收端;在各路服务器上利用新数据值引用/置入元素结构实现数据的远端直接内存访问,无需经过CPU拷贝等操作,提升了数据传输效率,同时在每组数据传输前加载子服务器机箱板卡编号用于解析具体拼接的通道位置,避免通道串扰;主服务器通过TCP/I P协议对各路子服务器实现指令同步操控,最终实现不低于128个通道数据实时采集与显示。
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公开(公告)号:CN113643396B
公开(公告)日:2023-05-12
申请号:CN202110897589.X
申请日:2021-08-05
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种扫频OCT图像处理方法及装置,该方法包括以下步骤:S1、干涉数据处理:对扫频OCT系统得到的干涉数据进行加窗处理以抑制噪声信号,然后再进行傅里叶变换,得到样品图像P0;S2、去除背景信息:对样品图像P0每行取平均提取条纹背景信息,然后对提取到的背景信息进行膨化操作得到背景图像,最后将样品图像P0减去背景图像,得到去除了图像条纹状伪影的OCT图像。本发明的方法能够对扫频OCT图像出现的散斑噪声、扫频光源噪声和光路条状伪影进行有效去除,从而可对OCT图像进行优化,提高OCT图像质量,应用于医学图像处理中时,能够便于医生从图像中准确、快速获取对诊断和观察病人病情有参考价值的信息。
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公开(公告)号:CN115343264A
公开(公告)日:2022-11-15
申请号:CN202210950547.2
申请日:2022-08-09
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种非平行光轴耦合的多位点双光子成像刺激装置,包括:飞秒激光器、激光扫描装置以及至少两路光学支路;光学支路包括第一聚焦光学元件、反射镜和第二聚焦光学元件;飞秒激光器发出的飞秒激光进入激光扫描装置,激光扫描装置使得飞秒激光在多个扫描区间之间反复扫描,每个扫描区间的飞秒激光经过一对应的光学支路后到达一个对应的目标位点;进入光学支路的飞秒激光经第一聚焦光学元件进行第一次聚焦后被反射至第二聚焦光学元件,进行第二次聚焦后到达对应的目标位点视野平面。本发明提供的非平行光轴耦合的多位点双光子成像刺激装置适合于对位于曲面样品上的多个存在空间夹角的平面视野区域进行双光子成像或光刺激。
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公开(公告)号:CN115077872A
公开(公告)日:2022-09-20
申请号:CN202210741960.8
申请日:2022-06-27
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: G01M11/02
Abstract: 本发明公开了一种适用于环形扫描双光子成像的分辨率检测系统及方法,该系统包括:光源模块、二向色镜、环形玻璃容器、具有抛物面的反射元件、用于驱动反射元件绕Z轴旋转的旋转驱动机构、用于驱动环形玻璃容器沿Z方向进行直线运动的直线驱动机构、光电倍增管、上位机以及软件模块。本发明通过旋转驱动机构带动反射元件绕Z轴旋转,并同步对装有荧光小球的环形玻璃容器进行环形扫描,通过直线驱动机构带动反射元件沿Z轴移动实现环形玻璃容器的轴向扫描,从而能够实现环形玻璃容器的全方位扫描,并通过图像重构获得荧光小球的成像结果,最后,通过对荧光小球所占有的像素数量和荧光小球真实尺寸进行分析,计算出环形扫描双光子成像系统的分辨率。
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