公开(公告)号：CN116790736B

公开(公告)日：2023-11-17

申请号：CN202311049377.1

申请日：2023-08-21

Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所

Inventor： 周连群 ,  高庆学 ,  郭振 ,  张威 ,  李金泽 ,  李传宇 ,  姚佳 ,  李树力 ,  李超 ,  杨弃

IPC: C12Q1/6869

Abstract: 本发明涉及一种利用单一荧光标签的DNA测序方法，属于分子生物学技术领域。本发明提供了一种利用单一荧光标签的DNA测序方法，先使用一种荧光标签标记四种含有不同碱基的dNTP分子，并通过控制四种含有不同碱基的dNTP分子在同一DNA测序反应体系中的浓度、机械力、相对分子质量、温度、酶催化、电、声和/或光，调节其在同一DNA测序反应体系中的扩散速率，以调控其参与DNA聚合反应的速率，使其表现出反应速率常数差异，再根据反应速率常数差异，识别出四种碱基，获得待测序DNA链的基因序列。所述DNA测序方法只需要一路激发‑探测光路，不依赖复杂光路系统，这将减小测序设备中光路系统的复杂性。

公开(公告)号：CN117025375A

公开(公告)日：2023-11-10

申请号：CN202310348371.8

申请日：2023-04-03

Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所

Inventor： 周连群 ,  徐绮 ,  李金泽 ,  李传宇 ,  杨弃 ,  张亚新 ,  张威 ,  张芷齐 ,  李超 ,  郭振 ,  姚佳

IPC: C12M1/34 ,  C12M1/00 ,  B01L3/00

Abstract: 本发明提供一种微流控芯片、微流控芯片组件和数字核酸检测进样装置。微流控芯片，包括：流道层，流道层设置有用于容纳检测试样的检测流道；流道层还设置有进液口，进液口连通检测流道；试剂孔板，试剂孔板适于预装检测试剂；试剂孔板上设置有从厚度方向贯穿试剂孔板的若干微孔；流道层设置有容纳槽，试剂孔板适于卡设于容纳槽中；检测流道位于容纳槽的槽底，试剂孔板卡设于容纳槽中时，微孔与检测流道直接连通，试剂孔板背向检测流道一侧的表面与流道层的表面齐平；封装膜层，封装膜层适于将试剂孔板封装于容纳槽中，封装膜层贴附并覆盖试剂孔板表面和试剂孔板周围的流道层表面；封装膜层具有透气性。本发明的方案可提高微流控芯片的检测效率。

公开(公告)号：CN116626011A

公开(公告)日：2023-08-22

申请号：CN202310906330.6

申请日：2023-07-24

Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所

Inventor： 郭振 ,  周连群 ,  高庆学 ,  张威 ,  李金泽 ,  李超 ,  杨弃 ,  李传宇 ,  姚佳 ,  李树力

IPC: G01N21/64

Abstract: 本发明公开了一种用于单分子动力学检测的纳米光学器件，包括：纳米结构芯片和激光器；激光器用于向纳米结构芯片发射激光；纳米结构芯片包括纳米孔，纳米孔用于检测单分子的结合行为以及在激光照射下的解离行为，纳米孔的直径范围为50nm至200nm。本发明实施例提供的单分子动力学检测的纳米光学器件，通过设置纳米结构芯片中纳米孔的直径为50nm至200nm，该纳米孔能够对入射的激光产生阻挡效应，产生有效激发体积小于典型的零模波导，获得更高的时间分辨率。从而解决目前对于单分子动力学检测时间分辨率较差的技术问题。

公开(公告)号：CN117089605B

公开(公告)日：2024-05-03

申请号：CN202311061603.8

申请日：2023-08-22

Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所

Inventor： 李金泽 ,  张琴琴 ,  周连群 ,  郭振 ,  李传宇 ,  李莹雪 ,  姚佳 ,  张威 ,  李超 ,  杨弃 ,  张芷齐

IPC: C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及一种基于FQ‑RCA的RNA等温实时基因分型方法，属于分子生物学技术领域。本发明提供了一种基于FQ‑RCA的RNA等温实时基因分型方法，先通过splintR DNA连接酶连接分别与野生型RNA和突变型RNA完全匹配的两条锁式探针，形成DNA环状模板，再通过含有两套FQ探针的RCA反应进行实时荧光信号检测。此方法将FQ探针和RCA技术结合，实现了对RCA反应中突变位点的实时检测，并结合了splintR DNA连接酶能够以RNA为夹板高效连接DNA的特性，以及两套锁式探针相互竞争减少非特异性连接的方法，可以直接以RNA为靶标进行SNP基因分型检测，无需逆转录成cDNA。

公开(公告)号：CN116625999B

公开(公告)日：2023-11-28

申请号：CN202310558188.0

申请日：2023-05-17

Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所

Inventor： 张威 ,  王璐 ,  郭振 ,  周连群 ,  李金泽 ,  姚佳 ,  李传宇 ,  张芷齐 ,  李超 ,  杨弃

IPC: G01N21/64 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明公开一种评估零模波导孔有效载样的方法，包括：制备酶‑引物‑模板三元复合物；将三元复合物和芯片绑定；对芯片进行荧光淬灭，找到具有单个荧光的孔；对芯片进行荧光累积，找到荧光能够持续累积的孔；确定荧光淬灭阶段具有单个荧光，且荧光累积阶段荧光能够持续累积的孔为有效载样孔。本发明还公开了上述方法的应用。本发明构建了一种评估零模波导孔有效载样的方法，使用一种简单的酶‑引物‑模板三元复合物作为研究模型，利用荧光淬灭和荧光累积的过程进行双重判定，有利于更精准地筛选出单分子实时测序的有效载样孔。同时，还能够用于整个测序体系的优化，通过调整来优化有效载样

公开(公告)号：CN116626011B

公开(公告)日：2023-10-03

申请号：CN202310906330.6

申请日：2023-07-24

Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所

Inventor： 郭振 ,  周连群 ,  高庆学 ,  张威 ,  李金泽 ,  李超 ,  杨弃 ,  李传宇 ,  姚佳 ,  李树力

IPC: G01N21/64

Abstract: 本发明公开了一种用于单分子动力学检测的纳米光学器件，包括：纳米结构芯片和激光器；激光器用于向纳米结构芯片发射激光；纳米结构芯片包括纳米孔，纳米孔用于检测单分子的结合行为以及在激光照射下的解离行为，纳米孔的直径范围为50nm至200nm。本发明实施例提供的单分子动力学检测的纳米光学器件，通过设置纳米结构芯片中纳米孔的直径为50nm至200nm，该纳米孔能够对入射的激光产生阻挡效应，产生有效激发体积小于典型的零模波导，获得更高的时间分辨率。从而解决目前对于单分子动力学检测时间分辨率较差的技术问题。