药物与靶点间的相互作用关系预测方法及装置

    公开(公告)号:CN112133367A

    公开(公告)日:2020-12-25

    申请号:CN202010824226.9

    申请日:2020-08-17

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本申请涉及一种药物与靶点间的相互作用关系预测方法及装置,所述方法包括:获取待预测药物‑靶点对,待预测药物‑靶点对包括待预测药物的药物特征,以及待预测靶点的靶点特征;根据药物特征确定待预测药物与已知药物的相似度,根据靶点特征确定待预测靶点与已知靶点的相似度;根据待预测药物与各已知药物的相似度、待预测靶点与各已知靶点的相似度,以及药物与靶点之间的已知相互作用关系,确定待预测药物‑靶点对的相互作用关系预测结果。上述方法通过药物特征、靶点特征以及已知的药物靶点之间相互作用关系来预测药物靶点之间的相互作用关系,无需提前知道靶点蛋白的结构,使得药物‑靶点关系对的预测在实际情况中更容易实现。

    药物与靶点间的相互作用关系预测方法及装置

    公开(公告)号:CN112133367B

    公开(公告)日:2024-07-12

    申请号:CN202010824226.9

    申请日:2020-08-17

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本申请涉及一种药物与靶点间的相互作用关系预测方法及装置,所述方法包括:获取待预测药物‑靶点对,待预测药物‑靶点对包括待预测药物的药物特征,以及待预测靶点的靶点特征;根据药物特征确定待预测药物与已知药物的相似度,根据靶点特征确定待预测靶点与已知靶点的相似度;根据待预测药物与各已知药物的相似度、待预测靶点与各已知靶点的相似度,以及药物与靶点之间的已知相互作用关系,确定待预测药物‑靶点对的相互作用关系预测结果。上述方法通过药物特征、靶点特征以及已知的药物靶点之间相互作用关系来预测药物靶点之间的相互作用关系,无需提前知道靶点蛋白的结构,使得药物‑靶点关系对的预测在实际情况中更容易实现。

    一种同时识别多种恶性肿瘤细胞的核酸适体及其应用

    公开(公告)号:CN114507668B

    公开(公告)日:2023-05-16

    申请号:CN202210207946.X

    申请日:2022-03-04

    Inventor: 蒲颖 印明柱 陈翔

    Abstract: 本发明公开了一种同时识别多种恶性肿瘤细胞的核酸适体及其应用,所述核酸适体PT‑2筛选自人甲状腺未分化癌CAL‑62和甲状腺乳头状腺癌TPC‑1,PT‑2核酸序列如序列表SEQ ID NO:4所示。本发明是通过活细胞筛选得到的,不仅能与人甲状腺未分化癌及甲状腺乳头状腺癌细胞系高亲和力结合,还能够与多种恶性程度较高的其他肿瘤细胞系具有高亲和力结合的核酸适体;核酸适体PT‑2无免疫原性、分子量小、易于修饰、取代和标记、能够体外化学合成;同时,核酸适体的序列稳定性良好,易于保存,方便标记;核酸适体合成成本较抗体低,周期短、重现性好;本发明可应用于人甲状腺未分化癌、甲状腺乳头状腺癌以及相关恶性肿瘤细胞的检测、并用于制备相关治疗药物。

    一种同时识别多种恶性肿瘤细胞的核酸适体及其应用

    公开(公告)号:CN114507668A

    公开(公告)日:2022-05-17

    申请号:CN202210207946.X

    申请日:2022-03-04

    Inventor: 蒲颖 印明柱 陈翔

    Abstract: 本发明公开了一种同时识别多种恶性肿瘤细胞的核酸适体及其应用,所述核酸适体PT‑2筛选自人甲状腺未分化癌CAL‑62和甲状腺乳头状腺癌TPC‑1,PT‑2核酸序列如序列表SEQ ID NO:4所示。本发明是通过活细胞筛选得到的,不仅能与人甲状腺未分化癌及甲状腺乳头状腺癌细胞系高亲和力结合,还能够与多种恶性程度较高的其他肿瘤细胞系具有高亲和力结合的核酸适体;核酸适体PT‑2无免疫原性、分子量小、易于修饰、取代和标记、能够体外化学合成;同时,核酸适体的序列稳定性良好,易于保存,方便标记;核酸适体合成成本较抗体低,周期短、重现性好;本发明可应用于人甲状腺未分化癌、甲状腺乳头状腺癌以及相关恶性肿瘤细胞的检测、并用于制备相关治疗药物。

    药物副作用关系预测方法、系统、计算机设备和存储介质

    公开(公告)号:CN112071439A

    公开(公告)日:2020-12-11

    申请号:CN202010837504.4

    申请日:2020-08-19

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本申请涉及一种药物副作用关系预测方法、系统、计算机设备和存储介质。该方法包括:获取待测关系对,待测关系对包含一待测药物和一目标副作用;基于待测药物和已知药物的药物信息、以及已知药物副作用关系,确定各种药物维度下待测关系对的第一关联得分;基于目标副作用和已知副作用的副作用信息、以及已知药物副作用关系,确定各种副作用维度下待测关系对的第二关联得分;基于待测药物、已知药物、目标副作用和已知副作用的网络连接信息、以及已知药物副作用关系,确定各种网络连接维度下待测关系对的第三关联得分;根据第一关联得分、第二关联得分以及第三关联得分,预测待测药物与目标副作用是否具有潜在关联。采用本方法能够提高预测准确性。

    分子靶标蛋白的筛选方法、装置、计算机设备和存储介质

    公开(公告)号:CN112053742A

    公开(公告)日:2020-12-08

    申请号:CN202010716290.5

    申请日:2020-07-23

    Abstract: 本申请涉及一种分子靶标蛋白的筛选方法、装置、计算机设备和存储介质。方法包括:获取目标分子,采用不同靶标预测方式对目标分子进行靶标预测,得到预测靶标蛋白,根据预测靶标蛋白对应的预测方式的数量,对预测靶标蛋白进行筛选,得到目标分子对应的潜在靶标蛋白,获取与潜在靶标蛋白对应的定量构效关系模型,将目标分子输入定量构效关系模型,得到目标分子与潜在靶标蛋白的结合活性概率,根据结合活性概率和预设的概率阈值,从潜在靶标蛋白中筛选出与目标分子匹配的关键靶标蛋白。实现了精准可靠的靶标蛋白的筛选。

    荧光酶抑制剂筛选模型构建方法及荧光酶抑制剂筛选方法

    公开(公告)号:CN112053741A

    公开(公告)日:2020-12-08

    申请号:CN202010715628.5

    申请日:2020-07-23

    Abstract: 本申请涉及一种荧光酶抑制剂筛选模型构建方法和荧光酶抑制剂筛选方法。所述荧光酶抑制剂筛选模型构建方法包括:获取模型训练集,计算模型训练集的分子描述符,对分子描述符进行特征选择,得到目标分子描述符集,根据目标分子描述符集和至少两种预设算法,建立初始荧光酶抑制剂筛选模型,初始荧光酶抑制剂筛选模型包括单种分子表征模型和组合表征模型,获取模型评估数据集、并根据模型评估数据集对初始荧光酶抑制剂筛选模型的预测能力进行评估,得到荧光酶抑制剂筛选模型。采用本方法能够构建出实用性和可信性高的荧光剂筛选模型。采用荧光酶抑制剂筛选方法,能够快速准确地筛选出非荧光酶抑制剂,节省时间和人力,提高荧光酶抑制剂的检测效率。

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