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公开(公告)号：CN114841245A
公开(公告)日：2022-08-02
申请号：CN202210352551.9
申请日：2022-04-05
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种基于图网络掩膜节点分类的固定骨架的蛋白质序列设计方法，在离线阶段，通过构建样本的蛋白质最近临图作为训练集，对图神经网络进行训练；在在线阶段，通过训练后的图神经网络对缺失序列的蛋白质结构的最临近图进行处理，得到缺失的氨基酸类别概率，然后对类别概率进行采样得到预测的缺失的氨基酸序列。本发明通过增加了更多的结构约束，在蛋白质图中相连的氨基酸对加入了距离和相对角度特征以及每个氨基酸的二面角特征，然后建立近邻图，实现了基于Transformer多头注意力机制的更高效的图网络并探究了最优的氨基酸mask比例。
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公开(公告)号：CN104860157A
公开(公告)日：2015-08-26
申请号：CN201410067100.6
申请日：2014-02-26
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种重物快速提升装置，包括斜面、底面、支撑杆、传动装置、运送装置以及驱动装置，所述斜面的底边与底面的一侧边通过合页连接，斜面的顶边与底面的另一侧边之间通过支撑杆支撑并固定；所述传动装置沿斜面设置于斜面上方并与驱动装置驱动连接，所述运送装置放置于斜面上并与传动装置传动连接。当运送装置上行并接触到常开开关时，小车改变运行方向，向下运动；当运送装置下行并接触到暂停开关时，小车停止运动。本发明以24w功率的电机承载重物至少有24kg，能效比高，同时上升下降300mm过程仅用近7秒，速度非常快。
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公开(公告)号：CN118098357A
公开(公告)日：2024-05-28
申请号：CN202410149193.0
申请日：2024-02-02
Applicant: 上海交通大学
IPC: G16B20/30 , G16B40/00 , G16B30/00 , G06N3/0455 , G06N3/048 , G06N3/0895
Abstract: 一种基于预训练表征和自注意力的siRNA抑制率预测方法，在离线阶段通过构建基于自注意力机制的深度神经网络，并针对siRNA的反义链序列和局部靶mRNA序列构建多种特征，用于对深度神经网络进行训练，在在线阶段采用训练后的深度神经网络对实时输入的待检测siRNA序列进行抑制率的预测。本发明对于siRNA的反义链序列和局部靶mRNA序列，利用预训练RNA‑FM模型进行嵌入式表征，转化为二维特征矩阵，在加上位置编码后，通过自注意力机制提取序列全局性的依赖信息，再加上来自热力学属性的特征作为全连接层的输入，进行充分的特征融合后，输出预测的siRNA抑制率。
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公开(公告)号：CN106230516A
公开(公告)日：2016-12-14
申请号：CN201610782815.9
申请日：2016-08-31
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种基于微波光子的雷达通信对抗一体化设计，包括系统光源、发射和接收端可调滤波模块、任意波形产生模块、发射和接收端调制器模块、光功率放大器模块、系统延时模块、发射和接收端端探测模块、微波天线模块、通道接收/直采接收模块、以及微处理器模块等。系统通过参数配置和芯片配置可以实现雷达探测、数字通信以及电子对抗三种信息系统的功能切换。通过任意波形产生模块可以产生用于三种系统的模拟信号或者数字信号。系统包含发射回路和接收回路，两者均采用相同的光源，确保了系统的相参性。同时在光子领域对微波信号进行处理，具有高带宽、低噪声性能的优点。本系统可以实现信息系统的功能化集成，提高系统的环境适应性和可重构性，可广泛用于超宽带雷达、数字通信以及电子对抗等信息技术领域。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114841245B
公开(公告)日：2025-05-02
申请号：CN202210352551.9
申请日：2022-04-05
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种基于图网络掩膜节点分类的固定骨架的蛋白质序列设计方法，在离线阶段，通过构建样本的蛋白质最近临图作为训练集，对图神经网络进行训练；在在线阶段，通过训练后的图神经网络对缺失序列的蛋白质结构的最临近图进行处理，得到缺失的氨基酸类别概率，然后对类别概率进行采样得到预测的缺失的氨基酸序列。本发明通过增加了更多的结构约束，在蛋白质图中相连的氨基酸对加入了距离和相对角度特征以及每个氨基酸的二面角特征，然后建立近邻图，实现了基于Transformer多头注意力机制的更高效的图网络并探究了最优的氨基酸mask比例。
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公开(公告)号：CN117316267A
公开(公告)日：2023-12-29
申请号：CN202311370274.5
申请日：2023-10-23
Applicant: 上海交通大学
IPC: G16B15/30 , G16B25/10 , G16B40/20 , G16B40/30 , G06F18/2135 , G06F18/22 , G06F18/231 , G06F18/27 , G06N3/0455 , G06N3/047 , G06N3/0475 , G06N3/0895
Abstract: 一种基于scGPT的小分子跨模态生成方法，用基因编码器与分子编码器分别对预处理后的基因转录谱与小分子数据编码并提取出特征后，用一个全连接层将两种模态映射到同一维度空间中并通过对比学习进行基因模态与小分子模态的多模态匹配；再将对齐后的基因向量通过自回归模型将基因模态转成小分子模态，最后将小分子向量还原成SMILES与Mol格式输出。本发明通过输入所需的基因表达谱和对照基因表达谱，得到能够诱导所需转录组谱的候选分子。
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公开(公告)号：CN116844644A
公开(公告)日：2023-10-03
申请号：CN202310832533.5
申请日：2023-07-08
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种基于反义链多维度嵌入表征的siRNA抑制率预测方法，在离线阶段通过构建深度神经网络并采用针对siRNA的反义链序列构建多维度特征进行训练，在在线阶段给定靶基因名称，获取全部候选siRNA序列，并采用训练后的深度神经网络对实时输入的候选siRNA序列进行沉默效率预测和排序。本发明对于siRNA的反义链序列，利用独热编码和预训练RNA‑FM模型的嵌入表示特征作为输入，以深度神经网络的方式构建siRNA抑制率预测模型，提高预测的有效性和精确性，并将其与基因表达序列搜索算法融合，构建了从靶基因名称输入到筛选高效siRNA序列的完整流程。
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公开(公告)号：CN106230516B
公开(公告)日：2018-09-14
申请号：CN201610782815.9
申请日：2016-08-31
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种基于微波光子的雷达通信对抗一体化设计，包括系统光源、发射和接收端可调滤波模块、任意波形产生模块、发射和接收端调制器模块、光功率放大器模块、系统延时模块、发射和接收端端探测模块、微波天线模块、通道接收/直采接收模块、以及微处理器模块等。系统通过参数配置和芯片配置可以实现雷达探测、数字通信以及电子对抗三种信息系统的功能切换。通过任意波形产生模块可以产生用于三种系统的模拟信号或者数字信号。系统包含发射回路和接收回路，两者均采用相同的光源，确保了系统的相参性。同时在光子领域对微波信号进行处理，具有高带宽、低噪声性能的优点。本系统可以实现信息系统的功能化集成，提高系统的环境适应性和可重构性，可广泛用于超宽带雷达、数字通信以及电子对抗等信息技术领域。
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公开(公告)号：CN106452729A
公开(公告)日：2017-02-22
申请号：CN201610767351.4
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开一种基于随机置换的白盒密码的加密方法，包括如下输入混淆函数P；随机置换S；输出混淆函数Q。本发明除了能够观测到查找表以外不能获得更多其它的信息，能够保证该加密方案不会由于遭受到白盒攻击而被攻击者恢复整个加密，即复制出一个具有相同加密功能的算法；从而保证了在不可信任终端运行加密算法的安全性。
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