公开(公告)号：CN118562933A

公开(公告)日：2024-08-30

申请号：CN202410810034.0

申请日：2024-06-21

Applicant: 深圳赛陆医疗科技有限公司

Inventor： 甘广丽 ,  李改玲 ,  王谷丰 ,  刘二凯 ,  赵陆洋

IPC: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明涉及一种低深度全基因组测序和靶向测序相结合的建库方法，包括以下步骤：使用针对样本适应性的限制性内切酶对核酸样本进行剪切，得到片段较长DNA片段；使用带有通用序列的随机引物和具有通用序列的基因特异性引物对的DNA片段进行扩增,得到扩增产物；使用接头引物对的扩增产物进行第二次扩增，即得到用于测序的DNA文库。本发明所述的低深度全基因组测序和靶向测序相结合的建库方法，可在低深度测序数据量情况下，同时检测拷贝数变异、点突变和插入缺失突变等，还具有方案操作简单，建库时间短的优势；构建的文库质量好，不含接头二聚体残留，文库片段集中，峰形好；可应用在遗传育种的基因分型上，病原的感染分析及耐药位点的检出等方向。

公开(公告)号：CN118006735A

公开(公告)日：2024-05-10

申请号：CN202410230122.3

申请日：2024-02-29

Applicant: 深圳赛陆医疗科技有限公司

Inventor： 傅德丰 ,  王谷丰 ,  刘二凯 ,  赵陆洋

IPC: C12Q1/6837 ,  C12Q1/6895 ,  C12Q1/6888 ,  C40B40/06 ,  C40B50/18 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明涉及一种SNP芯片及其制备方法和应用，所述SNP芯片包括其包括修饰有两种引物的固相载体，通过所述引物，在该固相载体上固定有由多个文库序列制备的寡核苷酸探针的簇，所述寡核苷酸探针从5’末端至3’末端依次包括P7序列，接头序列1、特异性杂交序列和所述文库序列经酶切后产生的至少四个核苷酸的序列，所述核苷酸任意选自A、T、C、G。本发明还提供所述SNP芯片的制备方法和由所述SNP芯片构成的试剂盒，所述SNP芯片具有高密度，能够检测2000万个以上的SNP位点，通量更高，可以适用于需要大通量地检测SNP变异位点的需求，通过规模效应降低成本。

公开(公告)号：CN117604076A

公开(公告)日：2024-02-27

申请号：CN202410042012.4

申请日：2024-01-11

Applicant: 深圳赛陆医疗科技有限公司

Inventor： 廖人杰 ,  王谷丰 ,  陈依玲 ,  刘二凯 ,  赵陆洋

IPC: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6874 ,  C40B40/06 ,  C40B50/06 ,  G16B30/00

Abstract: 本发明公开了一种空间组学芯片及其制备方法、以及样本中目标分子的检测方法，所述空间组学芯片的制备方法包括以下步骤：构建2~4条种子探针，再合成种子探针文库；其中，每条种子探针包括依次连接的第一接头、接头测序引物、空间编码、空间编码测序引物和第二接头，每条所述种子探针的空间编码测序引物之间不存在大于4个碱基的同源或互补序列；将种子探针文库进行混合，与固定于芯片基底的寡核苷酸进行杂交，再扩增形成包括不同空间编码测序引物的探针簇；根据种子探针的数量，进行相应次数的测序；在所述探针簇的末端生成mRNA捕获序列。本发明的空间组学芯片可以提高分辨率且保证测序质量。

公开(公告)号：CN117004698A

公开(公告)日：2023-11-07

申请号：CN202310873038.9

申请日：2023-07-17

Applicant: 深圳赛陆医疗科技有限公司

Inventor： 陆永艺 ,  玄曙光 ,  刘二凯 ,  王谷丰 ,  赵陆洋

IPC: C12Q1/6869

Abstract: 本发明的一种双端测序方法，将待测的双链模板多核苷酸加载于表面固定有引物的测序芯片中进行扩增，对第一待测模板链进行SBS测序；然后延伸合成获得第二待测模板链；在所述第二待测模板链的末端连接修饰有第二活性基团的dNTP，然后将所述第二活性基团与位于所述测序芯片表面的第一活性基团进行点击反应，对第二待测模板链进行SBS测序。本发明的双端测序方法，直接在第一待测模板链测序后扩增延伸第二待测模板链，并将第二待测模板链通过化学键固定于固相表面的进行测序，从而简化了生成固定于固相表面的第二待测模板链的流程，减轻了对芯片基材及DNA的损伤，同时能够降低扩增测序成本。

公开(公告)号：CN119685462A

公开(公告)日：2025-03-25

申请号：CN202411541014.4

申请日：2024-10-31

Applicant: 深圳赛陆医疗科技有限公司

Inventor： 刘二凯 ,  玄曙光 ,  陆永艺 ,  徐杰成

IPC: C12Q1/6874 ,  C12Q1/6806

Abstract: 本发明涉及一种用于NGS测序的线性化方法、测序芯片以及测序方法。所述线性化方法包括如下步骤：在DNA引物中引入单个核糖核苷，所述核糖核苷的2’‑OH位置修饰有羟基保护基团；线性化时，用切割试剂去除所述羟基保护基团，暴露核糖核苷的2’‑OH；切断核糖核苷位置的磷酸二脂键，导致DNA引物中的一条链断裂；其线性化反应式如下。本发明的新线性化方法能够非常快速、高效的切割去除一条DNA链，得到适用于测序的单链DNA模板，并且对DNA具有低损伤的优点，能够明显提升测序质量，并且具有稳定性好的优点，在实际PE测序应用中能够保持稳定的测序质量。#imgabs0#

公开(公告)号：CN115960988B

公开(公告)日：2025-01-21

申请号：CN202211595787.1

申请日：2022-12-13

Applicant: 深圳赛陆医疗科技有限公司

Inventor： 李改玲 ,  刘二凯 ,  王谷丰

IPC: C12Q1/6806

Abstract: 本发明公开了一种样本前处理的溶液及方法，所述溶液包括以下组分：盐酸胍2wt%‑5wt%、EDTA 2 mM~10mM、枸橼酸钠1%~5%、氢氧化钠0.5wt~4wt%、N‑乙酰‑L半胱氨酸0.5wt%~3wt%、海藻糖2wt%~10wt%。本发明的样本前处理的溶液，能实现对各种复杂样本进行前处理，且经前处理后，样本核酸提取不受影响，质量高；本发明的样本前处理方法，耗时短，处理后的样本可以有效保存，无需转管。

公开(公告)号：CN116646010B

公开(公告)日：2024-03-29

申请号：CN202310930697.1

申请日：2023-07-27

Applicant: 深圳赛陆医疗科技有限公司

Inventor： 夏慧华 ,  杨悦 ,  王谷丰 ,  刘二凯 ,  赵陆洋

IPC: G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G06F18/214 ,  G06F18/23 ,  G06F18/2411

Abstract: 本发明属于生物信息学技术领域，公开了一种人源性病毒检测方法及装置、设备、存储介质，通过对多个目标基因序列进行聚类分类获得多个聚类类别，将每个聚类类别中的代表性序列与人源性病毒对应的目标扩增子序列进行比对，获得比对结果，然后根据比对结果计算比对上目标扩增子序列的目标指标值、覆盖度和平均覆盖深度，输入分类模型进行预测获得分类结果，该分类结果用于表征从基因测序数据中是否检测到人源性病毒，从而无需将目标基因序列逐个与目标扩增子序列进行比对，可以大大降低比对耗时，进而提高检测效率。

公开(公告)号：CN115820380B

公开(公告)日：2024-01-30

申请号：CN202310010044.1

申请日：2023-01-04

Applicant: 深圳赛陆医疗科技有限公司

Inventor： 玄曙光 ,  张雯羽 ,  夏慧华 ,  刘二凯 ,  王谷丰

IPC: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  C12M1/00 ,  C12M1/34 ,  C12M1/36 ,  C12N15/11 ,  B01L3/00

Abstract: 本发明公开了一种微流控芯片及其制备方法和应用，所述微流控芯片表面修饰有引物P5和引物P7，所述引物P5和引物P7的其中一种的末端缺少1～3个碱基，或所述引物P5和引物P7的其中一种连接有可逆阻断基团。本发明的微流控芯片，引物P5和P7中的其中一种为可逆阻断的寡核苷酸引物，在文库杂交时，源自同一插入片段的一对互补序列，只有其中的一条能够在DNA聚合酶作用下进行延伸，并在桥式扩增过程中保留下来，因此，减少了DNA簇的生成，从而有效移除由互补文库模板扩增造成的测序重复率，提高了测序仪下机数据通量。

公开(公告)号：CN115960988A

公开(公告)日：2023-04-14

申请号：CN202211595787.1

申请日：2022-12-13

Applicant: 深圳赛陆医疗科技有限公司

Inventor： 李改玲 ,  刘二凯 ,  王谷丰

IPC: C12Q1/6806

Abstract: 本发明公开了一种样本前处理的溶液及方法，所述溶液包括以下组分：盐酸胍2wt%‑5wt%、EDTA 2 mM~10mM、枸橼酸钠1%~5%、氢氧化钠0.5wt~4wt%、N‑乙酰‑L半胱氨酸0.5wt%~3wt%、海藻糖2wt%~10wt%。本发明的样本前处理的溶液，能实现对各种复杂样本进行前处理，且经前处理后，样本核酸提取不受影响，质量高；本发明的样本前处理方法，耗时短，处理后的样本可以有效保存，无需转管。

公开(公告)号：CN119913234A

公开(公告)日：2025-05-02

申请号：CN202510109113.3

申请日：2025-01-23

Applicant: 深圳赛陆医疗科技有限公司

Inventor： 刘二凯 ,  傅德丰 ,  赵陆洋 ,  王谷丰

IPC: C12Q1/6806 ,  C40B50/06 ,  C40B40/06 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明涉及一种超高密度探针捕获的空间转录组学芯片的制备方法，以及由该制备方法得到的芯片，以及所述芯片在样品核酸分子检测中的应用。本发明通过在整个固体基质上修饰满DNA探针，包括poly T探针和带有TSO信息的探针，能够提高芯片的探针密度，从而提高基因检测效率以及分辨率，获得一种实验流程简捷、较低成本、高通量的空间转录组技术，能够应用高通量地探测基因表达水平的同时获得其空间位置信息。