公开(公告)号：CN111128378B

公开(公告)日：2023-08-25

申请号：CN201911278021.9

申请日：2019-12-12

Applicant: 暨南大学

Inventor： 杨恒文 ,  谭宇翔 ,  钟竞辉 ,  尹芝南

IPC: G16H50/30 ,  G06F18/243 ,  G06F18/2451 ,  G06F18/2132 ,  G06F18/214

Abstract: 本发明公开的一种用于评估婴幼儿肠道菌群发育年龄的预测方法，包括以下步骤：获取婴幼儿的肠道菌群数据；利用所述肠道菌群数据为基础，通过线性判别分析和随机森林构建预测模型，即分类数据模型；将待测样品输入预测模型进行预测，输出分类数据，得到预测结果；根据预测结果得到待测样品的肠道菌群发育年龄段；把得到待测样品的肠道菌群发育年龄段跟实际年龄进行比较，判断婴幼儿的肠道是否出现紊乱或者发育偏差；本发明采用线性判别分析和随机森林结合，构建预测模型，大大提高了准确率，通过预测模型预测出对应年龄，然后通过预测年龄和实际年龄的比较来评估菌群是否发育失调。

公开(公告)号：CN111128378A

公开(公告)日：2020-05-08

申请号：CN201911278021.9

申请日：2019-12-12

Applicant: 暨南大学

Inventor： 杨恒文 ,  谭宇翔 ,  钟竞辉 ,  尹芝南

IPC: G16H50/30 ,  G06K9/62

Abstract: 本发明公开的一种用于评估婴幼儿肠道菌群发育年龄的预测方法，包括以下步骤：获取婴幼儿的肠道菌群数据；利用所述肠道菌群数据为基础，通过线性判别分析和随机森林构建预测模型，即分类数据模型；将待测样品输入预测模型进行预测，输出分类数据，得到预测结果；根据预测结果得到待测样品的肠道菌群发育年龄段；把得到待测样品的肠道菌群发育年龄段跟实际年龄进行比较，判断婴幼儿的肠道是否出现絮乱或者发育偏差；本发明采用线性判别分析和随机森林结合，构建预测模型，大大提高了准确率，通过预测模型预测出对应年龄，然后通过预测年龄和实际年龄的比较来评估菌群是否发育失调。

公开(公告)号：CN110211636A

公开(公告)日：2019-09-06

申请号：CN201810155742.X

申请日：2018-02-23

Applicant: 暨南大学 ,  谭宇翔

Inventor： 谭宇翔 ,  张宇 ,  尹芝南

IPC: G16B30/00

Abstract: 本发明公开了一种优化基因组测序结果的分类方法，包括如下步骤：A)读取输入的多态性记录文本文件；B)根据注解对所述多态性记录文本文件的内容进行分类，得到相应的分类信息；所述分类信息包括同源单核苷酸多样性、同源插入缺失变化、异源单核苷酸多样性和异源插入缺失变化；C)对应不同的分类信息使用不同的过滤指标进行过滤，将不符合过滤标准的内容过滤掉，得到过滤后的结果；D)将所述过滤后的结果进行汇总并输出。实施本发明的优化基因组测序结果的分类方法，具有以下有益效果：能提高全基因组测序结果的精度。