公开(公告)号：CN112331263B

公开(公告)日：2021-07-23

申请号：CN202011135436.3

申请日：2020-10-22

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 林元震 ,  张卫华 ,  张紫阳 ,  刘艳 ,  魏瑞研

IPC: G16B20/00

Abstract: 本发明公开了一种基于个体遗传竞争与环境空间分析的林木基因组选择方法及其应用。该方法步骤如下：收集试验林所有个体的行列号，形成空间定位数据；测定试验林所有个体的表型形状，形成表型数据；采用全基因组重测序对试验林所有个体和待检测的个体进行SNP基因分型，将基因分型数据记录为0、1、2的SNP标记矩阵，根据SNP标记矩阵构建全部个体的基因组关系矩阵G；构建模型和数据分析。本发明的方法不仅能捕获林木个体间的遗传竞争关系，还能捕获种植环境的空间变异特性，充分考虑遗传材料和种植环境的背景差异，显著提高林木基因组选择的准确性；无树种、试验林和测试性状类型的具体限制，应用前景广泛。

公开(公告)号：CN112331263A

公开(公告)日：2021-02-05

申请号：CN202011135436.3

申请日：2020-10-22

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 林元震 ,  张卫华 ,  张紫阳 ,  刘艳 ,  魏瑞研

IPC: G16B20/00

Abstract: 本发明公开了一种基于个体遗传竞争与环境空间分析的林木基因组选择方法及其应用。该方法步骤如下：收集试验林所有个体的行列号，形成空间定位数据；测定试验林所有个体的表型形状，形成表型数据；采用全基因组重测序对试验林所有个体和待检测的个体进行SNP基因分型，将基因分型数据记录为0、1、2的SNP标记矩阵，根据SNP标记矩阵构建全部个体的基因组关系矩阵G；构建模型和数据分析。本发明的方法不仅能捕获林木个体间的遗传竞争关系，还能捕获种植环境的空间变异特性，充分考虑遗传材料和种植环境的背景差异，显著提高林木基因组选择的准确性；无树种、试验林和测试性状类型的具体限制，应用前景广泛。