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公开(公告)号:CN118853665A
公开(公告)日:2024-10-29
申请号:CN202410766641.1
申请日:2024-06-14
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12N15/113 , C12Q1/6895 , C12Q1/686 , G01N33/543 , G01N33/569 , G01N33/58 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了基于CRISPR/Cas12a的大白菜黑腐病检测方法及其相关材料和应用。具体公开了一种用于切割黑腐病rDNA‑ITS序列的Cas12a向导RNA分子,所述向导RNA分子包括靶向序列和结构序列,所述靶向序列的核酸序列为序列1的第4位‑第24位,所述结构的核酸序列为序列1的第25位‑第44位。使用向导RNA分子和及针对靶标设计的检测引物对待测样本进行Cas12a‑RPA检测,结果表明可快速、直观的检测到样本中是否含有目标基因组,可用于工农业生产。
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公开(公告)号:CN118599837A
公开(公告)日:2024-09-06
申请号:CN202410766644.5
申请日:2024-06-14
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12N15/113 , C12Q1/6895 , C12Q1/686 , G01N33/543 , G01N33/569 , G01N33/58 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了基于CRISPR/Cas12a的大白菜黄萎病检测方法及其相关材料和应用。具体公开了一种用于切割黄萎病rDNA‑ITS的Cas12a向导RNA分子,所述向导RNA分子包括靶向序列和结构序列,所述靶向序列的核酸序列为序列1的第4位‑第24位,所述结构的核酸序列为序列1的第25位‑第44位。使用向导RNA分子和及针对靶标设计的检测引物对待测样本进行cas12a‑RPA检测,结果表明可快速、直观的检测到样本中是否含有目标基因组,可用于工农业生产。
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公开(公告)号:CN114921582A
公开(公告)日:2022-08-19
申请号:CN202210561281.2
申请日:2022-05-23
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , C12Q1/686
Abstract: 本发明公开了一种芸薹种植物叶缘裂刻性状相关的分子标记及其应用。本发明提供了鉴定植物的叶缘裂刻性状的方法:检测植物基于Indel LMR的基因型,A基因型植物的叶缘表型为叶缘裂刻,B基因型植物的叶缘表型为叶缘全缘,H基因型植物的叶缘表型为叶缘裂刻;基因型判断方法:如2条同源染色体均不含有Indel LMR,为A基因型;如2条同源染色体均含有Indel LMR,为B基因型;如1条同源染色体含有Indel LMR,另1条同源染色体不含有Indel LMR,为H基因型;Indel LMR如SEQ ID NO:1所示。本发明开发了与叶缘裂刻性状紧密连锁的分子标记,利用分子标记辅助选择可以在早期对幼苗进行准确稳定的选择,从而减少工作量,加快育种进程。
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公开(公告)号:CN108998556B
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN201810994771.5
申请日:2018-08-29
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一种鉴定或辅助鉴定大白菜杂交结实率的SNP分子标记及其应用。本发明公开的SNP位点为BVRC_BrS2G/A位点,其位于大白菜基因组中的序列表中序列4自5’端第818位核苷酸,该位点为G/A多态。利用本发明所提供的BVRC_BrS2G/A位点及其所对应的引物鉴定大白菜杂交结实率的准确率达85.7%以上。由此表明,本发明所提供的BVRC_BrS2G/A位点及其所对应的引物将有助于杂交结实率高的大白菜种质资源的筛选,可用于分子标记辅助选择育种,为大白菜杂交亲和性性状的遗传改良提供材料储备和技术支持。
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公开(公告)号:CN110484645B
公开(公告)日:2020-07-28
申请号:CN201910840636.X
申请日:2019-09-05
Applicant: 北京市农林科学院 , 京研益农(北京)种业科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与大白菜抽薹性状相关的分子标记及其应用。本发明首先公开了SNP标记BrCSTF77‑46的多态性或基因型或检测如下SNP标记BrCSTF77‑46的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定白菜抽薹性状中的应用;所述SNP标记BrCSTF77‑46位于大白菜基因组A08染色体第18397561位核苷酸,其为G或T。本发明进一步公开了耐抽薹性状的大白菜的育种方法。本发明与大白菜抽薹性状相关的SNP分子标记,有利于大白菜抽薹性状的早期预测和筛选,为大白菜抽薹性状的分子标记辅助选择育种提供理论依据,促进了耐抽薹大白菜品种的选育。
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公开(公告)号:CN105603088B
公开(公告)日:2020-01-03
申请号:CN201610071673.5
申请日:2016-02-02
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种鉴定位于白菜A08染色体上的霜霉病抗性QTL的SNP分子位点及其应用。本发明提供了A0817684339T/C位点在如下A‑F任一中的应用:A、在鉴别或辅助鉴别白菜霜霉病抗性中的应用;B、在选育白菜霜霉病抗病品种中的应用;C、白菜育种中的应用;D、预测白菜霜霉病抗性中的应用;E、在制备鉴别或辅助鉴别白菜霜霉病抗性产品中的应用;F、在制备预测白菜霜霉病抗性产品中的应用。本发明的实验证明了,本发明所提供的SNP位点及其特异引物可以对白菜霜霉病抗性良好分型,具有良好的应用价值,可实现对抗霜霉病遗传材料的的预先选择和辅助育种。
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公开(公告)号:CN110484645A
公开(公告)日:2019-11-22
申请号:CN201910840636.X
申请日:2019-09-05
Applicant: 北京市农林科学院 , 京研益农(北京)种业科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与大白菜抽薹性状相关的分子标记及其应用。本发明首先公开了SNP标记BrCSTF77-46的多态性或基因型或检测如下SNP标记BrCSTF77-46的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定白菜抽薹性状中的应用;所述SNP标记BrCSTF77-46位于大白菜基因组A08染色体第18397561位核苷酸,其为G或T。本发明进一步公开了耐抽薹性状的大白菜的育种方法。本发明与大白菜抽薹性状相关的SNP分子标记,有利于大白菜抽薹性状的早期预测和筛选,为大白菜抽薹性状的分子标记辅助选择育种提供理论依据,促进了耐抽薹大白菜品种的选育。
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公开(公告)号:CN105506130B
公开(公告)日:2019-03-08
申请号:CN201610025560.1
申请日:2016-01-15
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种鉴定白菜病毒病TuMV‑C4小种抗性的、定位于A09染色体的SNP分子标记及其应用。本发明的SNP分子标记由序列2所示的单链DNA分子、序列3所示的单链DNA分子和序列4所示的单链DNA分子组成。通过对92个单株组成的BC1群体对分子标记的验证结果显示:该SNP分子标记的选择准确率在85%以上,可用于分子标记辅助育种,并为进一步定位和克隆基因奠定了良好的基础。
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公开(公告)号:CN108103239A
公开(公告)日:2018-06-01
申请号:CN201810178804.9
申请日:2018-03-05
Applicant: 北京市农林科学院 , 京研益农(北京)种业科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了鉴定大白菜芜菁花叶病毒病抗性的SNP分子标记A045736268C/T及其应用。本发明提供了检测待测白菜基因组中A045736268C/T位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测白菜的芜菁花叶病毒抗性中的应用;本实验利用DH群体,通过苗期人工摩擦接种TuMV,借助已有的白菜基因组信息进行抗性基因定位和分子标记开发,初步研究表明大白菜TuMV的抗性基因位于A04号染色体上,所开发的与该抗性基因紧密连锁的SNP标记无论在抗病还是感病材料中的选择准确率均为100%,可用于分子标记辅助选择育种。该项研究将为大白菜芜菁花叶病毒病抗性基因的进一步定位克隆及种质资源创新奠定基础。
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公开(公告)号:CN106460063A
公开(公告)日:2017-02-22
申请号:CN201580030487.0
申请日:2015-11-26
Applicant: 北京市农林科学院
CPC classification number: C12Q1/68 , C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开了一种用于白菜遗传多样性分析及分子育种的SNP组合及其应用。本发明所提供的应用具体为571个SNP位点或用于检测所述571个SNP位点的物质在如下任一中的应用:(1)构建白菜DNA指纹数据库;(2)白菜种质资源遗传多样性分析和/或进化分析;(3)白菜分子育种;所述571个SNP位点的物理位置是基于白菜品种Chiifu-402-2的全基因组序列比对确定的,所述白菜品种Chiifu-402-2的全基因组序列的版本号为V1.5;所述571个SNP位点是BrSNPA01001-BrSNPA10043。实验证明,这571个SNP位点能够应用于白菜遗传多样性分析、进化分析;同时这571个SNP位点还可用于白菜分子育种,为其提供重要的技术支撑。
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