一种基于DNA计算的探针机实现方法及装置

    公开(公告)号:CN107437003A

    公开(公告)日:2017-12-05

    申请号:CN201710581927.2

    申请日:2017-07-17

    Applicant: 北京大学

    CPC classification number: G06F19/22

    Abstract: 本发明实施例提供一种基于DNA计算的探针机实现方法及装置。所述方法包括根据待求解数学问题获取预设条件,并根据所述预设条件对DNA折纸结构和DNA单链分别进行DNA序列编码;构建数据库包括所述DNA折纸结构;构建探针库包括所述DNA单链;将所述DNA折纸结构和所述DNA单链在计算平台进行混合反应以得到反应产物;通过检测器检测所述反应产物以得到计算结果。本发明实施例利用DNA计算中的DNA折纸结构和DNA单链构成探针机提高了计算机的处理能力,且使计算结果易于检测,能够有效改善传统的算法自组装的错配率较大的问题,提高计算结果的可靠性,在三维立体空间上数据之间任意交流,特异性的组装。

    一种DNA-纳米金颗粒型探针机实现方法与装置

    公开(公告)号:CN114388054B

    公开(公告)日:2024-12-27

    申请号:CN202111451976.7

    申请日:2021-12-01

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明涉及一种DNA‑纳米金颗粒型探针机实现方法与装置。所述方法包括,将待解问题映射为图问题;根据图问题分别对DNA‑纳米金颗粒和DNA单链进行DNA序列编码;构建含有已编码的DNA‑纳米金颗粒的数据库;构建含有已编码的DNA单链的探针库,将所需数据集与探针集放入计算平台进行混合反应,获得反应产物;对反应产物进行检测,得到计算结果。本发明利用DNA与纳米金颗粒的结合,实现底层数据全并行计算模式,提高计算结果的可靠性。又因纳米金颗粒自带光谱特性,使得探针机计算结果更易于检测。

    一种DNA折纸处理方法、装置、设备及介质

    公开(公告)号:CN115651930A

    公开(公告)日:2023-01-31

    申请号:CN202211236893.0

    申请日:2022-10-10

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明提供一种DNA折纸处理方法、装置、设备及介质,可以获得存在有待填充中空区域的二维DNA线框;二维DNA线框在待填充中空区域的预设边缘点位处包括有待与目标填充单链相连接的至少一条辅助链,目标填充单链包括通过相互勾连可形成平面结构的至少两种类别的DNA单链;利用预设的填充处理方式,使得各类别的DNA单链通过相互勾连以及连接各辅助链的方式,来填充二维DNA线框中的待填充中空区域。本发明可以利用较少类别的DNA单链作为订书钉链,在待填充中空区域内进行相互勾连以及连接辅助链,形成可填充待填充中空区域的平面结构,实现对待填充中空区域的填充和固定二维DNA折纸的结构,减少为固定DNA折纸而需的订书钉链种类,减少资源消耗,降低填充成本。

    一种DNA折纸处理方法及装置
    4.
    发明公开

    公开(公告)号:CN115627269A

    公开(公告)日:2023-01-20

    申请号:CN202211236619.3

    申请日:2022-10-10

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明提供一种DNA折纸处理方法及装置,可以获得六个均带有尾部结构且边长均为第一边长的三角形折纸;利用预定义的结构处理方式,分别对各三角形折纸进行结构处理,以获得可连接为正六边形折纸的六个处理后三角形折纸;结构处理方式包括碱基序列编码处理方式和尾部结构标记处理方式,各处理后三角形折纸均包括尾部结构标记;控制六个处理后三角形折纸连接为正六边形折纸。本发明可以对六个三角形折纸进行结构处理,获得可以连接为正六边形折纸且均包括尾部结构标记的六个处理后三角形折纸,将六个处理后三角形折纸连接为正六边形折纸,此时正六边形折纸中即包括六个处理后三角形折纸的尾部结构标记,有效增强对正六边形折纸的标记的可靠性。

    一种DNA-纳米金颗粒型探针机实现方法与装置

    公开(公告)号:CN114388054A

    公开(公告)日:2022-04-22

    申请号:CN202111451976.7

    申请日:2021-12-01

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明涉及一种DNA‑纳米金颗粒型探针机实现方法与装置。所述方法包括,将待解问题映射为图问题;根据图问题分别对DNA‑纳米金颗粒和DNA单链进行DNA序列编码;构建含有已编码的DNA‑纳米金颗粒的数据库;构建含有已编码的DNA单链的探针库,将所需数据集与探针集放入计算平台进行混合反应,获得反应产物;对反应产物进行检测,得到计算结果。本发明利用DNA与纳米金颗粒的结合,实现底层数据全并行计算模式,提高计算结果的可靠性。又因纳米金颗粒自带光谱特性,使得探针机计算结果更易于检测。

    一种基于DNA计算的探针机实现方法及装置

    公开(公告)号:CN107437003B

    公开(公告)日:2021-03-23

    申请号:CN201710581927.2

    申请日:2017-07-17

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明实施例提供一种基于DNA计算的探针机实现方法及装置。所述方法包括根据待求解数学问题获取预设条件,并根据所述预设条件对DNA折纸结构和DNA单链分别进行DNA序列编码;构建数据库包括所述DNA折纸结构;构建探针库包括所述DNA单链;将所述DNA折纸结构和所述DNA单链在计算平台进行混合反应以得到反应产物;通过检测器检测所述反应产物以得到计算结果。本发明实施例利用DNA计算中的DNA折纸结构和DNA单链构成探针机提高了计算机的处理能力,且使计算结果易于检测,能够有效改善传统的算法自组装的错配率较大的问题,提高计算结果的可靠性,在三维立体空间上数据之间任意交流,特异性的组装。

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