本实用新型涉及细胞分选技术领域，公开了一种用于单细胞蛋白质组样品前处理的微流控芯片，微流控芯片包括芯片本体，其具有依次连通设置的注液孔、第一流道、第二流道、捕获室、第三流道以及收集孔，注液孔设为多个，第一流道与注液孔数量相等且一一对应，第一流道和第二流道之间设置有第一气阀，捕获室设置有反应微孔，反应微孔用于分选出单个细胞，第三流道设有多个蛇形段，任意相邻的两个蛇形段之间设置有第二气阀。基于上述结构，无需采用移液装置对不同工序的反应液移动，细胞分选、蛋白变性、还原、烷基化以及酶解的所有工序均可在本微流控芯片中完成，整合度更高，反应更彻底，提高分选的效率。