本发明公开了一种低腥味的DHA藻油的制备方法，包括以下步骤：S1.在保护气氛下，将粗制藻油依次进行脱胶、脱酸、脱色和冬化处理，然后对冬化处理的藻油进行脱臭，得到精制藻油；S2.将所述精制藻油中添加复合抗氧化剂，混合均匀后，得到所述低腥味的DHA藻油；其中，通过脱酸处理控制粗制藻油的酸价≤0.5。本发明还公开了由所述方法制备得到的低腥味的DHA藻油。本发明公开的低腥味的DHA藻油的制备方法，该方法生产的DHA藻油含量可达到40～65％，SN‑2DHA占总DHA的比例可达到40～55％，过氧化值低于1meq/kg，茴香胺值低于2.5，且几乎不含有DHA特有的腥味，其滋味和气味呈无味或者仅有淡淡青草味。