本发明提供一种聚乙二醇化重组人促红素的毛细管电泳纯度检测方法，包括以下步骤：(1)使用PNGase F酶将待测聚乙二醇化重组人促红素进行脱N糖处理，得到脱N糖后的PEG‑EPO；(2)加入SDS对脱N糖后的PEG‑EPO进行孵育变性；(3)进行毛细管凝胶电泳，并根据不同组分的峰面积比计算待测样品的纯度。本发明解决了传统SDS‑PAGE方法定量准确度欠佳，毛细管电泳技术测定该类药物纯度时，峰数目多、峰型变形，主成分和杂质无法有效分离，进而无法定量的问题，保证了纯度测定的准确性和可靠性。本发明的方法具有专属性更高、可更精准定量、适于推广应用的特点。