拟南芥AtUBP6基因在提高植物抗性方面的应用属基因工程技术领域，本发明提供了拟南芥AtUBP6基因的应用，该基因可提高拟南芥对菌核病抗性。相比于野生型拟南芥，AtUBP6基因的T‑DNA插入缺失突变株，对菌核病表现出更弱的抗病性，且突变体体内主要防御基因的表达量在病原物侵染前后差异更加显著。拟南芥的AtUBP6与菌核病发病关系密切，可将该基因及其在其他十字花科植物中的同源基因，应用于十字花科植物育种，具有良好的应用前景。