本发明公开了一种新型冠状病毒动物感染模型的构建方法和应用，涉及分子生物学技术和动物基因工程领域，本发明制备的病毒复制子，只在特定的稳定表达新型冠状病毒SARS‑CoV‑2N蛋白的细胞中完成多轮复制，而在其他细胞中则不能复制，其生物安全风险大大降低，是一种能在BSL‑2实验室里能操作的系统。此外，本发明利用缺失N基因的SARS‑CoV‑2反式互补复制子系统，感染组织特异性或特定时间表达SARS‑CoV‑2N蛋白的小鼠模型，成功构建了一种能在BSL‑2实验室内使用的安全型新型冠状病毒SARS‑CoV‑2动物感染模型，可应用于筛选抗新型冠状病毒药物的筛选和研发。