本发明适用于供氢系统控制技术领域，提供了一种用于移动供氢系统的控制单元及控制方法，所述控制单元包括包括第一可控阀门、第二可控阀门、第三可控阀门、第四可控阀门、第五可控阀门、第六可控阀门、第七可控阀门以及安全阀。该控制单元可根据不同需求选择供氢方式，对外加氢时，氢气存储端为燃料电池端运行供氢，氢气产生端给加氢机供氢，为外部加氢；当氢气存储端无氢时，可通过氢气产生端为燃料电池端运行供氢，同时为氢气存储端加氢。通过控制单元将有机液储氢技术与燃料电池增程式汽车有机结合，可作为移动加氢站，有效解决了氢能汽车加氢难，以及野外加氢、三高试验加氢和运行路线受限等问题。