本发明涉及豆类籽粒加工技术领域，具体公开了一种豆类籽粒皮层与子叶分离设备，包括微波加热设备和安装架，微波加热设备安装在安装架的顶部，微波加热设备的两端均安装有封堵板，安装架的内部安装有输送带，输送带的表面安装有多个放置盒，多个放置盒的内部均设置有翻动机构，安装架的顶部安装有两个固定架，两个固定架的底部设置有驱动机构，安装架的一端设置有分离箱，分离箱的内部安装有自动分离机构。该发明中，通过设置的微波加热设备和分离箱，能够采用微波脱皮的方法对豆类籽粒的皮层和子叶进行自动分离，效率极高；并通过设置的翻动机构，方便对豆类籽粒进行翻动，提高豆类籽粒皮层和子叶分离的效率。