本发明提出一种基于近红外高光谱图像识别和LIBS数据融合的红花质量生产调配方法及系统，训练得到红花的图像‑羟基红花黄色素A浓度识别模型；对同一批次不同包装的红花分别进行近红外高光谱图像数据采集，并通过红花的图像‑羟基红花黄色素A浓度识别模型得到各自的羟基红花黄色素A浓度；通过激光诱导击穿光谱仪LIBS对步骤S2中所述同一批次不同包装的红花进行检测得到无机离子浓度；将所述同一批次不同包装的红花的羟基红花黄色素A浓度和无机离子浓度通过深度强化学习模型DQN进行调配决策，得到调配方案。本发明有效的降低中药材批次内的质量波动，提升产品的质量一致性。