本发明公开了一种高产吲哚乙酸菌株MCC16及应用，属于连作马铃薯栽培技术领域。本发明提供的高产吲哚乙酸菌株MCC16分类名为泛菌(Pantoea sp.)，保藏于中国普通微生物菌种保藏管理中心，保藏地址为北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所，保藏日期为2023年12月11日，保藏编号为CGMCC NO.29287。该菌株能有效缓解马铃薯因连作障碍导致的植株弱小、产量降低、品质下降等现象，促进连作条件下马铃薯植株生长及产量的提升。