本发明属于污水处理领域，具体涉及一种微生物复合材料包括固定载体、藻类、复合菌剂和复合酶；所述藻类、复合菌剂和复合酶负载在所述固定载体上，且所述藻类负载在最外层；所述固定载体为复配活性炭、石墨、焦炭、生物炭、改性活性炭、多孔氧化铝、多孔陶瓷中的一种或多种组合；所述藻类为小球藻、螺旋藻、栅藻、硅藻、纤维藻、月芽藻、席藻中的一种或多种组合；本发明的微生物复合材料能够尾水中的营养物质、一些雌激素、酚类、胺类、醛类、苯类等进行氧化去除，去除尾水中的新兴污染物；本发明还提出了一种微生物复合材料去除尾水中污染物的方法，将所述微生物复合材料浸没于需处理尾水中，在光照和曝气条件下进行，并保持气水体积比为(0.5‑1.5):1。