本发明提供了一种棉花GhSP2基因及其编码蛋白在调节植物开花中的应用。具体涉及到在棉花花芽分化前在棉花茎尖中持续表达的GhSP2基因，GhSP2蛋白定位在细胞膜和细胞核中，在棉花开花过程中发挥和重要的作用。本申请在拟南芥中过量表达GhSP2基因后，抽薹和开花显著推迟，而在棉花中将该基因沉默后，棉花植株的开花时间提前，同时株高变矮，表明该基因能够调控植物的开花时间。由此可知，基因GhSP2及其编码蛋白可以作为一种潜在的分子育种工具，通过调控棉花的开花时间，提高棉花品种对不同生态区的适应性。