本发明涉及烟叶分拣技术领域，具体公开了一种用于烟叶分拣的生产线运行管理系统及方法，包括：获取分拣线单位时间的烟叶输入量S0，并计算最大调整量ΔK；计算单位调整量ΔK'，并通过主运输线将各个分拣线的单位时间的烟叶输入量调整为Si；获取各个分拣线的烟叶输出量Ri，并计算计划完成度Di；筛选出各个分拣线中计划完成度的最大值，并获取与所述的最大值的差值的绝对值小于等于预设阈值d的其他计划完成度，并定义为初始完成度；获取初始完成度对应的分拣线的烟叶输出量R，计算出初始调整量S1，并将烟叶输入量调整为S1；并根据各个分拣线的烟叶输出量对烟叶输入量进行二次调整。本发明解决了常规技术中生产力得不到有效利用的问题。