本发明公开了一种认知FDA‑MIMO雷达网干扰抑制和目标跟踪方法及系统，包括：在第t个CPI生成目标状态和协方差矩阵；基于第t个CPI的回波信号和第t个CPI的目标状态，确定第t个CPI的干扰加噪声协方差矩阵Rh,IN和目标协方差矩阵Rh,S；基于第t个CPI的回波信号、Rh,IN和Rh,S确定第t个CPI的目标的量测值；基于该量测值更新第t个CPI的目标状态和协方差矩阵；将第t个CPI的更新后的目标状态和协方差矩阵发送至融合中心，并接收融合中心将H部雷达的第t个CPI的更新后的目标状态和协方差矩阵进行融合后所得到的目标状态和协方差矩阵；在第t+1个CPI内，根据融合后的目标状态和协方差矩阵继续跟踪目标。本发明能提高跟踪准确性。