本发明公开一种变压器高压侧三相电流互感器二次侧中线断线判别方法，包括：采集变压器高压侧三相电流和高压侧中性点零序电流；计算变压器高压侧自产零序电流基波有效值；计算高压侧中性点零序电流基波和各整数次谐波有效值；响应于变压器空充初始时，变压器高压侧自产零序电流基波有效值低于定值，且高压侧中性点零序电流基波有效值高于定值，且高压侧中性点零序电流各整数次谐波之和与基波比值高于定值，判为变压器高压侧三相电流互感器二次侧中线断线故障。此种技术方案解决了变压器正常运行时三相电流几乎完全对称，零序电流极小，变压器高压侧三相电流互感器二次侧中线断线难以判别的问题。