本发明公开了一种双回路电机式泥浆脉冲发生器，包括依次相连的脉冲发生器、驱动短节、电池筒短节和探管短节；脉冲发生器包括外管、设在外管内且依次连接的电路转换器、电机箱体、电机减速器、定子和转子以及力矩传感器；电机箱体内设有双回路无刷直流电机；定子和转子上设有过流通道；驱动短节能控制脉冲发生器产生循环泥浆脉冲波动。本发明通过电机补偿回路对泥浆液流速进行同步，减少泥浆液冲击等导致的非线性因素对脉冲发生器造成的扰动，确保电机位置回路输出轴带动的旋转阀精确快速地跟踪驱动短节发送的指令信号，以抑制脉冲发生器输出波形发生的畸变，显著降低地面解码环节中信号滤波和识别环节的难度。