本发明提供了一种益生菌饲料及其保存方法。其中，该保存方法包括：将经微生物发酵得到的益生菌饲料进行真空保存；其中，益生菌饲料的含水量为33‑56％，真空保存的真空度为‑0.011～‑0.098MPa。本申请提出了利用真空环境来防止氧气和湿气对具有一定含水量的饲料的损害，延长饲料的保质期的技术。在真空环境下，氧气和湿气的含量极低，可以减缓饲料中的氧化和霉变反应，从而延长饲料的保质期，减少饲料的损失，降低饲料成本，同时也减少了对环境的污染风险，能够保持益生菌的活性和稳定性，延长益生菌饲料的保质期，并且能够有效阻止氧气和湿气对益生菌的损害，从而提高长期保存的益生菌饲料的效果和质量。