本发明公开了一种地震动输入方法、设备及存储介质，所述方法包括建立考虑真实地质地形条件的场址有限元模型，计算底部边界块的等效地震荷载，基于底部边界块的等效地震荷载计算一维角柱的自由场地震动时程；基于一维角柱的自由场地震动时程计算一维角柱的等效地震荷载；基于底部边界块和一维角柱的等效地震荷载计算侧面边界块的自由场地震动时程；基于侧面边界块的自由场地震动时程计算侧面边界块的等效地震荷载；将底部边界块和侧面边界块的等效地震荷载输入至场址有限元模型，计算三维真实地质地形条件下场址与工程结构的动力响应。本发明能够简单有效地实现考虑真实地质地形效应的场址处的地震动输入。