本发明公开了烟草多酚氧化酶NtPPO5及其编码基因、重组表达载体和应用。本发明的烟草多酚氧化酶编码基因NtPPO5，其核苷酸序列为：(1)SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列；或(2)SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列经取代和/或缺失和/或添加一个或多个核苷酸且表达相同功能蛋白的核苷酸序列。经检测发现，过表达NtPPO5基因，可以显著增加烟草植株中多酚氧化酶的活性；而且过表达NtPPO5基因的烟草植株节距增加、总叶片和花蕾数减少，能有效改善烟草植株的株型；另外过表达NtPPO5基因在烟叶成熟期能降低多酚类物质绿原酸和芦丁含量。