本发明公开了一种病理影像扫描分析系统及方法，属于病理影像分析技术领域，包括教学模块、数据储存库和病理识别模块；所述教学模块用于对接各目标组织，向目标组织提供对应的素材数据，并实时接收各目标组织内指导人员的反馈数据，根据所述反馈数据生成对应的自学习数据；所述数据储存库用于储存各第一用户的素材数据；所述病理识别模块用于对第一用户上传的病理影像进行分析，输出对应的系统解读数据，方法包括：建立病理解读模型，通过病理解读模型对第一用户上传的病理影像进行分析，输出对应的系统解读数据；将对应的病理影像和系统解读数据整合为素材数据，将素材数据发送值数据储存库进行储存。