本发明提供一种农业用水效率和生态环境效应的统一评价方法。该基于一种农业用水效率和生态环境效应的统一评价方法，包括以下步骤，S1、明确模型的应用场景、需要解决的问题，并根据所需要的目标选定量化指标，并构建指标公式，S2、收集用于计算所选指标数据，对收集的数据进行数据清洗、异常值处理、缺失值插补。通过设计水‑作物‑生态相互作用的综合模型的整体性分析，能够综合考虑作物生长、水资源分配、灌溉效率和生态影响之间的相互关系，提供系统的全景视图，反映了随时间变化的过程，可以模拟长期的动态变化，预测未来的趋势和结果，可以确定模型中哪些参数是关键因素，增加普适性。