本发明提供了一种坐标测量仪器的正交轴系统，坐标测量装置包括具有第一旋转轴的第一旋转装置和可围绕第一旋转装置旋转且具有第二旋转轴的第二旋转装置，调校第一旋转轴和第二旋转轴包括测量第一旋转轴的轴线和第二旋转轴的轴线的垂直误差，若垂直误差不小于第一预设值，基于垂直误差调整第一旋转轴的轴线和第二旋转轴的相对位置以降低垂直误差；测量第一旋转轴的轴线和第二旋转轴的轴线的异面误差，若异面误差不小于第二预设值，基于异面误差调整第一旋转轴的轴线和第二旋转轴的相对位置以降低异面误差。由此，能够降低第一旋转轴和第二旋转轴的垂直误差和异面误差。