本发明公开了一种安全可信的三方设备指纹认证方法，应用于隐私计算与物联网安全技术领域。包括以下步骤：S1、认证准备阶段：将参与指纹认证的主体划分为设备方U、服务方P和存储方V，上传并验证可信执行环境TEE的执行程序；S2、认证初始化阶段：在服务方P建立可信执行环境TEE，并建立可信执行环境TEE与设备方U、存储方V的安全信道；S3、设备指纹认证阶段：设备方U与存储方V分别将指纹、指纹库通过安全信道上传至可信执行环境TEE，完成设备指纹认证后，通过安全信道获得认证结果。本发明可以实现安全高效的设备指纹认证，同时保证了设备方和存储方的隐私数据不能被窃取。