本发明公开了一种独立变桨与偏航协同控制的风电机组轮毂载荷抑制方法，该方法包括：建立风电机组轮毂疲劳载荷计算的非线性机理模型；根据小信号分析法，对根据所述非线性机理模型进行线性化处理，得到风电机组线性化模型；建立两自由度控制框架；根据所述风电机组线性化模型以及所述两自由度控制框架，获得状态空间方程模型；建立模型预测控制器，根据所述状态空间方程模型，对风电机组轮毂进行载荷抑制。本发明可以实现风电机组的功率跟踪以及轮毂疲劳载荷的抑制，可广泛应用于风力发电机技术领域。