本发明属于农药残留检测技术领域，具体涉及一种基于液滴微流控芯片的农药残留检测方法。首先制备Au@信标@Ag NPs‑免疫探针溶液和Fe3O4‑抗体复合材料溶液；然后制备微流体芯片，进一步基于微流体芯片搭建农药SERS免疫标记液滴微流体芯片系统，其可在自动进样装置的驱动下自动完成农药残留检测过程中多种试剂的混合反应，操作简单，提高SERS标记免疫检测过程的自动化程度和信号采集的稳定性，同时采用液滴流动形式提高了微流控芯片重复适用性，有利于降低检测成本，适合于果蔬、土壤、水体等环境样本中农药残留的快速、自动和稳定检测，具有良好的实用前景。