本公开实施例涉及一种基于氧自由基的关系确定方法、装置、设备及介质，其中该方法包括：将目标水通道蛋白模型，插入目标水通道蛋白模型对应的目标膜模型中，得到细胞膜模型；统计不同预设跨膜参数下，待处理氧自由基穿过细胞膜模型中的目标水通道蛋白模型的统计数量；其中，预设跨膜参数包括：细胞膜模型两侧的跨膜电压、细胞膜模型两侧的氧自由基浓度差中的至少一个；根据预设跨膜参数和统计数量，确定参数数量关系。本公开实施例，以跨膜电压、氧自由基浓度中的至少一个作为自变量，确定相应的统计数量，进而实现了参数数量关系的构建，基于该参数数量关系能够定量的对水通道蛋白将氧自由基转运入细胞的生物过程进行分析和计算。